Integrative analysis of single-cell and spatial transcriptomics characterizes the tumor microenvironment in HGSOC patients
Mostra el registre complet Registre parcial de l'ítem
- dc.contributor.author Cervilla García, Sergi
- dc.date.accessioned 2022-12-05T13:38:10Z
- dc.date.available 2022-12-05T13:38:10Z
- dc.date.issued 2022-06-21
- dc.description Treball de fi de grau en Bioinformàtica. Curs 2021-2022ca
- dc.description Tutors: Eduard Porta Pardo i Mireia Olivellaca
- dc.description.abstract El microambient tumoral té un rol clau en la iniciació i progressió del càncer d’ovari serós d’alt grau. Per aquesta raó, la seva caracterització podria incrementar el nostre coneixement de la malaltia i el desenvolupament de nous tractaments que finalment millorarien la resposta dels pacients. Presentem un nou anàlisis basat en les dades que integra transcriptòmica espacial i de cèl·lules individuals que descriu l’estructura i les interaccions entre cèl·lules canceroses i les cèl·lules que constitueixen el microambient tumoral en pacients no tractats i tractats amb quimioteràpia.ca
- dc.description.abstract El microambiente tumoral tiene un rol clave en la iniciación y progresión del cáncer de ovario seroso de alto grado. Por esta razón, su caracterización podría incrementar nuestro conocimiento de la enfermedad y el desarrollo de nuevos tratamientos que por fin mejorarían la respuesta de los pacientes. Presentamos un análisis basados en datos que integra transcriptómica espacial y de células individuales que describen la estructura y las interacciones entre células cancerosas y las células que constituyen el microambiente tumoral en pacientes no tratados y tratados con quimioterapia
- dc.description.abstract The tumor microenvironment (TME) plays a key role in the initiation and progression of High Grade Serous Ovarian Cancer. For this reason, its characterization would increase our understanding of this disease and the development of new targeted treatments, eventually improving the outcome of patients. We present a novel data-driven analysis that integrates spatial transcriptomics and single-cell data to characterize the structure and the interaction between cancer cells and the cells populating the TME in non-treated and treated patients with chemotherapy.en
- dc.format.mimetype application/pdf*
- dc.identifier.uri http://hdl.handle.net/10230/55087
- dc.language.iso engca
- dc.rights This is an Open Access article distributed under the terms of the Creative Commons Attribution-NonCommercial-NoDerivs 3.0 licenseca
- dc.rights.accessRights info:eu-repo/semantics/openAccessca
- dc.rights.uri http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/es/ca
- dc.subject.keyword Transcriptòmica espacialca
- dc.subject.keyword Transcriptòmica de cèl·lules individualsca
- dc.subject.keyword Càncer d’ovari serós d’alt grauca
- dc.subject.keyword Microambient tumoralca
- dc.subject.keyword Transcriptómica espacial
- dc.subject.keyword Transcriptómica de células individuales
- dc.subject.keyword Cáncer
- dc.subject.keyword Cáncer de ovario seroso de alto grado
- dc.subject.keyword Microambiente tumoral
- dc.subject.keyword Spatial transcriptomicsen
- dc.subject.keyword Single-cell transcriptomicsen
- dc.subject.keyword Canceren
- dc.subject.keyword High grade serous ovarian canceren
- dc.subject.keyword Tumor microenvironmenten
- dc.subject.other Treball de fi de grau – Curs 2021-2022ca
- dc.title Integrative analysis of single-cell and spatial transcriptomics characterizes the tumor microenvironment in HGSOC patientsca
- dc.type info:eu-repo/semantics/bachelorThesisca