Strain detection and genetic diversity in Mediterranean marine microbial populations

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• dc.contributor.author Rodríguez Llana, Sergio
• dc.date.accessioned 2021-11-18T12:56:09Z
• dc.date.available 2021-11-18T12:56:09Z
• dc.date.issued 2021
• dc.description Treball de fi de grau en Bioinformàtica. Curs 2020-2021ca
• dc.description Tutor: Ramiro Logares Hauriéca
• dc.description.abstract Les poblacions microbianes marines exerceixen un paper fonamental en l’ecologia dels mars. El potencial adaptatiu d’aquestes espècies és essencial per comprendre l’evolució de les seves poblacions a través de l’espai i el temps. Això comporta entendre i predir com podrien reaccionar a determinades condicions ambientals, incloent-hi la temperatura de l’aigua, i com la mida de la població podria canviar com a conseqüència. En aquest projecte, investiguem la formació de soques en alguns genomes de població abundants explorant la seva diversitat genètica, buscant variacions genètiques principalment presents en estacions d'aigua calenta i observant quines són les principals funcions proteiques que estan sent afectades.ca
• dc.description.abstract Las poblaciones microbianas marinas desempeñan un papel fundamental en la ecología de los mares. El potencial adaptativo de estas especies es esencial para comprender la evolución de sus poblaciones a través del espacio y el tiempo. Esto conlleva entender y predecir cómo podrían reaccionar a ciertas condiciones ambientales, incluyendo la temperatura del agua, y cómo el tamaño de la población podría cambiar como consecuencia. En este proyecto, investigamos la formación de cepas en algunos genomas de población abundantes explorando su diversidad genética, buscando variaciones genéticas principalmente presentes en estaciones de agua caliente y observando cuáles son las principales funciones proteicas que están siendo afectadas.
• dc.description.abstract Marine microbial populations play a key role in the ecology of the seas. The adaptive potential of these species is key to understanding the evolution of their populations across time and space. This means to comprehend and predict how they may react to certain environmental conditions, including water temperature, and how their population size may change as a consequence. In this project, we investigate the strain formation within some abundant population genomes exploring their genetic diversity, looking into genetic variations present mainly in hot water seasons, and observing which are the primary protein functions that are being affected.en
• dc.format.mimetype application/pdf*
• dc.identifier.uri http://hdl.handle.net/10230/49017
• dc.language.iso engca
• dc.rights This is an Open Access article distributed under the terms of the Creative Commons Attribution-NonCommercial-NoDerivs 3.0 licenseca
• dc.rights.accessRights info:eu-repo/semantics/openAccessca
• dc.rights.uri http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/es/ca
• dc.subject.keyword Socaca
• dc.subject.keyword Diversitat genèticaca
• dc.subject.keyword Metagenòmicaca
• dc.subject.keyword Poblacions microbianes marinesca
• dc.subject.keyword Evolucióca
• dc.subject.keyword Adaptacióca
• dc.subject.keyword Factors ambientalsca
• dc.subject.keyword Variacions genètiquesca
• dc.subject.keyword SNPs
• dc.subject.keyword Funció proteicaca
• dc.subject.keyword Cepa
• dc.subject.keyword Diversidad genética
• dc.subject.keyword Metagenómica
• dc.subject.keyword Poblaciones microbianas marinas
• dc.subject.keyword Evolución
• dc.subject.keyword Adaptación
• dc.subject.keyword Factores ambientales
• dc.subject.keyword Variaciones genéticas
• dc.subject.keyword Función proteica
• dc.subject.keyword Strainen
• dc.subject.keyword Genetic diversityen
• dc.subject.keyword Metagenomicsen
• dc.subject.keyword Marine microbial populationsen
• dc.subject.keyword Evolutionen
• dc.subject.keyword Adaptationen
• dc.subject.keyword Environmental factorsen
• dc.subject.keyword Genetic variationsen
• dc.subject.keyword Protein functionen
• dc.subject.other Treball de fi de grau – Curs 2020-2021ca
• dc.title Strain detection and genetic diversity in Mediterranean marine microbial populationsca
• dc.type info:eu-repo/semantics/bachelorThesisca