Role of histone modifications in transcription regulation upon environmental stress in eukaryotes

Mostra el registre complet Registre parcial de l'ítem

• dc.contributor.author Bae, Hansol
• dc.contributor.other Posas Garriga, Francesc
• dc.contributor.other Nadal, Eulàlia de
• dc.contributor.other Universitat Pompeu Fabra. Departament de Medicina i Ciències de la Vida
• dc.date.accessioned 2024-10-16T10:25:02Z
• dc.date.available 2024-10-16T10:25:02Z
• dc.date.issued 2024-05-10T14:23:22Z
• dc.date.issued 2024-05-10T14:23:22Z
• dc.date.issued 2024-04-26
• dc.date.modified 2024-05-10T18:10:46Z
• dc.description.abstract Epigenetic modification serves as a crucial mechanism in regulating gene expression and facilitating cellular adaptation to environmental stress. This study aimed to identify histone residues and their associated post-translational modifications (PTMs) that contribute to stress response and adaptation in the eukaryotic model organism Saccharomyces cerevisiae. A comprehensive set of histone mutants was analyzed to understand the transcriptional and phenotypic effects of potential histone PTMs. Through rigorous selection criteria and extensive experimental validation, we refined our list of candidate histone residues for further study. Histone H3 lysine 64 (H3-K64) emerged as a key player, exhibiting significant transcriptional effects in a PTM-dependent manner. We postulated the PTM involved in this process and investigated the potential regulatory mechanisms of those PTMs involved in this process. Our findings suggest a potential association of the stress response modulating transcription factor, Msn2, and the Set domain-containing methyltransferase, Set1, in the regulation of H3-K64 methylation.
• dc.description.abstract La modificación epigenética desempeña un papel crucial en la regulación de la expresión génica y en la adaptación celular al estrés ambiental. Este estudio tuvo como objetivo identificar los residuos de histonas y sus modificaciones postraduccionales (PTMs) asociadas que contribuyen a la adaptación al estrés en el modelo eucariota S. cerevisiae. Se analizó un conjunto de mutantes de histonas para entender los efectos transcripcionales y fenotípicos de las PTMs de histonas. Aplicando criterios de selección rigurosos y una extensa validación experimental, refinamos nuestra lista de residuos candidatos para profundizar en su estudio. La histona H3 lisina 64 (H3-K64) exhibió defectos transcripcionales significativos de manera dependiente de sus PTMs. Postulamos posibles mecanismos regulatorios y propusimos las PTMs involucradas en este proceso. Sugerimos una asociación del factor de transcripción que modula la respuesta al estrés, Msn2, y la metiltransferasa con dominio Set, Set1, en la regulación de la metilación de H3-K64.
• dc.description.abstract Programa de Doctorat en Biomedicina
• dc.format 146 p.
• dc.format application/pdf
• dc.identifier http://hdl.handle.net/10803/690850
• dc.identifier.uri http://hdl.handle.net/10230/61460
• dc.language.iso eng
• dc.publisher Universitat Pompeu Fabra
• dc.rights ADVERTIMENT. Tots els drets reservats. L'accés als continguts d'aquesta tesi doctoral i la seva utilització ha de respectar els drets de la persona autora. Pot ser utilitzada per a consulta o estudi personal, així com en activitats o materials d'investigació i docència en els termes establerts a l'art. 32 del Text Refós de la Llei de Propietat Intel·lectual (RDL 1/1996). Per altres utilitzacions es requereix l'autorització prèvia i expressa de la persona autora. En qualsevol cas, en la utilització dels seus continguts caldrà indicar de forma clara el nom i cognoms de la persona autora i el títol de la tesi doctoral. No s'autoritza la seva reproducció o altres formes d'explotació efectuades amb finalitats de lucre ni la seva comunicació pública des d'un lloc aliè al servei TDX. Tampoc s'autoritza la presentació del seu contingut en una finestra o marc aliè a TDX (framing). Aquesta reserva de drets afecta tant als continguts de la tesi com als seus resums i índexs.
• dc.rights info:eu-repo/semantics/openAccess
• dc.source TDX (Tesis Doctorals en Xarxa)
• dc.subject.keyword Histone post-translational modification
• dc.subject.keyword Transcription regulation
• dc.subject.keyword Environmental stress
• dc.subject.keyword Stress adaptation
• dc.subject.keyword Saccharomyces cerevisiae
• dc.subject.keyword Modificación postraduccional de histonas
• dc.subject.keyword Regulación de la transcripción
• dc.subject.keyword Estrés ambiental
• dc.subject.keyword Adaptación al estrés
• dc.subject.keyword 577
• dc.title Role of histone modifications in transcription regulation upon environmental stress in eukaryotes
• dc.type info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
• dc.type info:eu-repo/semantics/publishedVersion