Analysis of genetic variation in microrna-mediated regulation and the susceptibility to anxiety disorders

Mostra el registre complet Registre parcial de l'ítem

• dc.contributor.author Muiños Gimeno, Margarita
• dc.contributor.other Espinosa Parrilla, Yolanda
• dc.contributor.other Universitat Pompeu Fabra. Departament de Ciències Experimentals i de la Salut
• dc.date.accessioned 2024-03-16T02:33:35Z
• dc.date.available 2024-03-16T02:33:35Z
• dc.date.issued 2011-04-12T16:29:27Z
• dc.date.issued 2010-02-11
• dc.date.issued 2009-12-18
• dc.date.issued 2010-02-11
• dc.date.modified 2024-03-15T10:57:23Z
• dc.description.abstract We have investigated genetic variation in microRNA-mediated regulation as a susceptibility factor for anxiety disorders following two different approaches. We first studied two isoforms of the candidate gene NTRK3 by re-sequencing its different 3'UTRs in patients with Panic (PD) and Obsessive Compulsive disorders (OCD) as well as controls. Two rare variants that altered microRNA-mediated regulation were identified in PD. Conversely, association of a common SNP with OCD hoarding subtype was found. Moreover, we have also studied a possible involvement of microRNAs in anxiety disorders. Consequently, we have analysed the genomic organisation and genetic variation of miRNA-containing regions to construct a panel of SNPs for association analysis. Case-control studies revealed several associations. However, it is worth remarking the associations of miR-22 and miR-488 with PD; two microRNAs for which functional assays and transcriptome analysis after microRNA overexpression showed significant repression of a subset of genes involved in physiological pathways linked to PD development.
• dc.description.abstract Hem investigat la variació genètica a la regulació mediada per microRNAs com a factors de susceptibilitat pels trastorns d'ansietat seguint dues aproximacions diferents. Primer vam estudiar dues isoformes del gen candidat NTRK3 mitjançant la reseqüenciació dels seus diferents 3'UTRs a pacients de pànic (TP), a pacients amb trastorn obsessiu compulsiu (TOC) i a controls. Dues variants rares que alteren la regulació mediada per microRNAs foren identificades per TP. D'altra banda, es trobà associació d'un SNP comú amb el subtipus acumulador de TOC. A més, també hem estudiat la possible implicació dels microRNAs als trastorns d'ansietat. Conseqüentment, hem analitzat l'organització genòmica i la variació genètica a regions que contenen microRNAs per construir un panell d'SNPs per fer anàlisis d'associació. Els estudis cas-control van revelar algunes associacions. Tanmateix, val la pena destacar les associacions del miR-22 i el miR-488 amb TP; dos microRNAs pels quals assajos funcionals i anàlisis de transcriptoma després de la seva sobreexpressió han mostrat una repressió significativa d'un grup de gens implicats en vies fisiològiques lligades al desenvolupament del TP.
• dc.description.abstract Programa de doctorat en Biomedicina
• dc.format application/pdf
• dc.format application/pdf
• dc.identifier 9788469307540
• dc.identifier http://www.tdx.cat/TDX-0211110-134946
• dc.identifier http://hdl.handle.net/10803/7192
• dc.identifier B.8788-2010
• dc.identifier.uri http://hdl.handle.net/10230/11840
• dc.language.iso eng
• dc.publisher Universitat Pompeu Fabra
• dc.rights ADVERTIMENT. L'accés als continguts d'aquesta tesi doctoral i la seva utilització ha de respectar els drets de la persona autora. Pot ser utilitzada per a consulta o estudi personal, així com en activitats o materials d'investigació i docència en els termes establerts a l'art. 32 del Text Refós de la Llei de Propietat Intel·lectual (RDL 1/1996). Per altres utilitzacions es requereix l'autorització prèvia i expressa de la persona autora. En qualsevol cas, en la utilització dels seus continguts caldrà indicar de forma clara el nom i cognoms de la persona autora i el títol de la tesi doctoral. No s'autoritza la seva reproducció o altres formes d'explotació efectuades amb finalitats de lucre ni la seva comunicació pública des d'un lloc aliè al servei TDX. Tampoc s'autoritza la presentació del seu contingut en una finestra o marc aliè a TDX (framing). Aquesta reserva de drets afecta tant als continguts de la tesi com als seus resums i índexs.
• dc.rights info:eu-repo/semantics/openAccess
• dc.source TDX (Tesis Doctorals en Xarxa)
• dc.subject.keyword isoforma
• dc.subject.keyword anàlisi de transcriptoma
• dc.subject.keyword PCR
• dc.subject.keyword assaig de luciferasa
• dc.subject.keyword variant comuna
• dc.subject.keyword variant rara
• dc.subject.keyword reseqüenciar
• dc.subject.keyword estudis d'associació
• dc.subject.keyword poly-miRTS
• dc.subject.keyword trastorn obsessiu-compulsiu
• dc.subject.keyword trastorn de pànic
• dc.subject.keyword trastorn d'ansietat
• dc.subject.keyword variació genètica intraespecífica
• dc.subject.keyword SNP
• dc.subject.keyword NTRK3
• dc.subject.keyword gen candidat
• dc.subject.keyword element regulador
• dc.subject.keyword microRNA
• dc.subject.keyword variació genòmica
• dc.subject.keyword desordres poligènics
• dc.subject.keyword trets complexes
• dc.subject.keyword isoform
• dc.subject.keyword transcriptome analysis
• dc.subject.keyword PCR
• dc.subject.keyword luciferase assay
• dc.subject.keyword common variant
• dc.subject.keyword rare variant
• dc.subject.keyword re-sequencing
• dc.subject.keyword association studies
• dc.subject.keyword poly-miRTS
• dc.subject.keyword obsessive-compulsive disorder
• dc.subject.keyword panic disorder
• dc.subject.keyword anxiety disorder
• dc.subject.keyword genetic variation within species
• dc.subject.keyword SNP
• dc.subject.keyword NTRK3
• dc.subject.keyword candidate gene
• dc.subject.keyword regulatory element
• dc.subject.keyword microRNA
• dc.subject.keyword genome variation
• dc.subject.keyword polygenic disorders
• dc.subject.keyword complex traits
• dc.subject.keyword 575
• dc.title Analysis of genetic variation in microrna-mediated regulation and the susceptibility to anxiety disorders
• dc.type info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
• dc.type info:eu-repo/semantics/publishedVersion