Deciphering the role of alternatively spliced microexons during vertebrate nervous system development and function

Mostra el registre complet Registre parcial de l'ítem

• dc.contributor.author López Blanch, Laura
• dc.contributor.other Irimia Martínez, Manuel
• dc.contributor.other Universitat Pompeu Fabra. Departament de Ciències Experimentals i de la Salut
• dc.date.accessioned 2024-03-16T02:34:48Z
• dc.date.available 2024-03-16T02:34:48Z
• dc.date.issued 2021-05-14T14:49:05Z
• dc.date.issued 2023-04-30T22:45:26Z
• dc.date.issued 2021-04-30
• dc.date.modified 2024-03-15T10:57:36Z
• dc.description.abstract Neural microexons are the most conserved type of alternative splicing, suggesting a strong functional relevance. Consistently, mutation of their master regulators leads to dramatic neurodevelopmental alterations and autistic-like behaviors. However, the functional relevance of individual microexons has only been elucidated for a few cases. Here, I aimed at investigating the roles of individual microexons using zebrafish as a model system. We selected 18 microexons conserved from fish to humans and generated deletion lines using CRISPR-Cas9. None of these deletions produced gross phenotypic alterations or affected viability and fertility. However, a finer characterization using different tests I have developed or adapted during my PhD revealed a wide range of phenotypes at the cellular, tissular, behavioral and/or molecular level. Interestingly, in many cases, these phenotypes were in opposite directions, a pattern that was mirrored at the transcriptomic level. Altogether, our results depict a rich scenario for the functionality of microexons.
• dc.description.abstract Els microexons neurals són el tipus més conservat de “splicing” alternatiu, fet que indica una gran rellevància funcional. A més a més, s’ha observat que mutacions produïdes en els seus principals reguladors desencadenen conseqüències dràstiques en el neuro-desenvolupament i també produeixen fenotips que s’aproximen a comportaments observats en l’autisme. Tot i així, les funcions concretes dels microexons individuals han estat descrites en pocs casos. L’objectiu principal d’aquest projecte és investigar les funcions individuals dels microexons. Per dur-ho a terme hem utilitzat el peix zebra com a model animal. Hem seleccionat 18 microexons, conservats entre peixos i humans, i hem generat línies mutants de CRSPR-cas9 per deleccionarlos. Cap de les línies generades mostra alteracions fenotípiques rellevants ni presenta alteracions en la viabilitat o fertilitat dels individus. Tanmateix, mitjançant una caracterització acurada dels fenotips i emprant diferents tests, que he desenvolupat i adaptat durant el transcurs del doctorat, hem detectat tot un ventall de fenotips a nivell cel·lular, tissular, molecular i conductual. Curiosament, en la majoria dels casos els fenotips van en direccions oposades, un patró que veiem perfectament reflectit a nivell transcriptòmic. Els resultats en conjunt, ens mostren un escenari molt ric per la funcionalitat dels microexons
• dc.description.abstract Programa de doctorat en Biomedicina
• dc.format 172 p.
• dc.format application/pdf
• dc.format application/pdf
• dc.identifier http://hdl.handle.net/10803/671657
• dc.identifier.uri http://hdl.handle.net/10230/47572
• dc.language.iso eng
• dc.rights ADVERTIMENT. Tots els drets reservats. L'accés als continguts d'aquesta tesi doctoral i la seva utilització ha de respectar els drets de la persona autora. Pot ser utilitzada per a consulta o estudi personal, així com en activitats o materials d'investigació i docència en els termes establerts a l'art. 32 del Text Refós de la Llei de Propietat Intel·lectual (RDL 1/1996). Per altres utilitzacions es requereix l'autorització prèvia i expressa de la persona autora. En qualsevol cas, en la utilització dels seus continguts caldrà indicar de forma clara el nom i cognoms de la persona autora i el títol de la tesi doctoral. No s'autoritza la seva reproducció o altres formes d'explotació efectuades amb finalitats de lucre ni la seva comunicació pública des d'un lloc aliè al servei TDX. Tampoc s'autoritza la presentació del seu contingut en una finestra o marc aliè a TDX (framing). Aquesta reserva de drets afecta tant als continguts de la tesi com als seus resums i índexs.
• dc.rights info:eu-repo/semantics/openAccess
• dc.source TDX (Tesis Doctorals en Xarxa)
• dc.subject.keyword 575
• dc.title Deciphering the role of alternatively spliced microexons during vertebrate nervous system development and function
• dc.type info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
• dc.type info:eu-repo/semantics/publishedVersion