Control of G2/M cell cycle transition by a complex of the splicing factors SPF45/SR140/CHERP

Full item page Simple item page

• dc.contributor.author Martín Rodríguez, Elena
• dc.contributor.other Valcárcel, J. (Juan)
• dc.contributor.other Universitat Pompeu Fabra. Departament de Ciències Experimentals i de la Salut
• dc.date.accessioned 2024-03-16T02:34:56Z
• dc.date.available 2024-03-16T02:34:56Z
• dc.date.issued 2018-06-06T15:39:52Z
• dc.date.issued 2018-06-06T15:39:52Z
• dc.date.issued 2018-01-24
• dc.date.modified 2024-03-15T10:57:20Z
• dc.description.abstract A splicing network analysis that captured functional similarities among spliceosomal components, revealed a prominent core module containing splicing factors SPF45, SR140 and CHERP. We report that these factors form a complex, as they stabilize each other’s protein levels, coimmunoprecipitate and co-sediment in glycerol gradients. Depletion of SPF45, SR140 or CHERP in HeLa cells impairs progression through the G2/M phase of the cell cycle and this is correlated with decreased cell proliferation and increased apoptosis. Transcriptome-wide analyses revealed extensive overlap between alternative splicing events regulated by SPF45, SR140 or CHERP and that common targets are enriched in G2/M transition genes. A relevant alternative splicing change was identified in FOXM1, a key transcriptional regulator of G2/M transition. Depletion of SPF45, SR140 or CHERP promotes total or partial inclusion of FOXM1 exon 9, which disrupts the transactivation domain and results in a non-functional FOXM1 isoform. We propose that alternative splicing regulation of FOXM1 contributes to the cell cycle G2/M phase arrest observed upon SPF45, SR140 or CHERP knock down and discuss possible physiological scenarios for this regulation.
• dc.description.abstract Un análisis de red de factores de splicing capturó similaridades funcionales entre componentes del spliceosoma y reveló un prominente módulo central que contiene a los factores de splicing SPF45, SR140 y CHERP. Hemos demostrado que estos factores forman un complejo, ya que estabilizan mutuamente sus niveles de proteínas, coinmunoprecipitan y co-sedimentan en gradientes de glicerol. La depleción de SPF45, SR140 o CHERP en células HeLa impide la progresión a través de la fase G2/M del ciclo celular y ello se correlaciona con una disminución de la proliferación celular y un aumento de la apoptosis. Análisis globales del transcriptoma han revelado un sustancial solapamiento entre los eventos de splicing alternativo regulados por SPF45, SR140 o CHERP y que las dianas comunes están enriquecidas en genes implicados en la transición G2/M. Se ha identificado un cambio de splicing alternativo relevante en FOXM1, un regulador transcripcional clave en la transición G2/M. La depleción de SPF45, SR140 o CHERP promueve la inclusión total o parcial del exon 9 de FOXM1, lo que interrumpe el dominio de transactivación y da lugar a una isoforma no funcional de FOXM1. Proponemos que la regulación del splicing alternativo de FOXM1 contribuye al arresto en la fase G2/M del ciclo celular observado cuando se deplecionan SPF45, SR140 o CHERP y discutimos posibles escenarios fisiológicos para esta regulación.
• dc.description.abstract Programa de doctorat en Biomedicina
• dc.format 165 p.
• dc.format application/pdf
• dc.format application/pdf
• dc.identifier http://hdl.handle.net/10803/572042
• dc.identifier.uri http://hdl.handle.net/10230/34860
• dc.language.iso eng
• dc.publisher Universitat Pompeu Fabra
• dc.rights ADVERTIMENT. L'accés als continguts d'aquesta tesi doctoral i la seva utilització ha de respectar els drets de la persona autora. Pot ser utilitzada per a consulta o estudi personal, així com en activitats o materials d'investigació i docència en els termes establerts a l'art. 32 del Text Refós de la Llei de Propietat Intel·lectual (RDL 1/1996). Per altres utilitzacions es requereix l'autorització prèvia i expressa de la persona autora. En qualsevol cas, en la utilització dels seus continguts caldrà indicar de forma clara el nom i cognoms de la persona autora i el títol de la tesi doctoral. No s'autoritza la seva reproducció o altres formes d'explotació efectuades amb finalitats de lucre ni la seva comunicació pública des d'un lloc aliè al servei TDX. Tampoc s'autoritza la presentació del seu contingut en una finestra o marc aliè a TDX (framing). Aquesta reserva de drets afecta tant als continguts de la tesi com als seus resums i índexs.
• dc.rights info:eu-repo/semantics/openAccess
• dc.source TDX (Tesis Doctorals en Xarxa)
• dc.subject.keyword Alternative splicing
• dc.subject.keyword SPF457SR1407CHERP complex
• dc.subject.keyword G2/M transition
• dc.subject.keyword FOXM1
• dc.subject.keyword Splicing alternativo
• dc.subject.keyword Complejo SPF45/SR140/CHERP
• dc.subject.keyword Transición G2/M
• dc.subject.keyword FOXM1
• dc.subject.keyword 576
• dc.title Control of G2/M cell cycle transition by a complex of the splicing factors SPF45/SR140/CHERP
• dc.type info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
• dc.type info:eu-repo/semantics/publishedVersion