Comparative genomics on bacterivorous marine heterotrophic flagellates
Mostra el registre complet Registre parcial de l'ítem
- dc.contributor.author Segura Retana, Pol
- dc.date.accessioned 2024-04-26T09:36:59Z
- dc.date.available 2024-04-26T09:36:59Z
- dc.date.issued 2023-06-21
- dc.description Treball de fi de grau en Bioinformàtica. Curs 2022-2023ca
- dc.description Tutor: Ramon Massanaca
- dc.description.abstract El projecte consisteix a construir un assemblatge de novo del genoma de quatre espècies de flagel·lats heteròtrofs, després realitzar una predicció genètica sobre els genomes construïts, seguit d'un anàlisi funcional de cadascuna de les espècies, estem buscant específicament quatre enzims digestius; després, construirem els arbres filogenètics en base a aquestes quatre proteïnes involucrades. L'objectiu és esbrinar si la nostra espècie té o no gens relacionats amb la fagocitosi bacteriana i la relació entre ells.ca
- dc.description.abstract El proyecto consiste en construir un ensamblaje de novo del genoma de cuatro especies de flagelados heterótrofos, luego realizar una predicción genética sobre los genomas construidos, seguido de un análisis funcional de cada una de las especies, estamos buscando específicamente cuatro enzimas digestivas, luego, construiremos los árboles filogenéticos en base a estas cuatro proteínas involucradas. El objetivo es averiguar si nuestra especie tiene o no genes relacionados con la fagocitosis bacteriana y la relación entre ellos.
- dc.description.abstract The project consists in build a complete genome de novo assembly of four heterotrophic flagellate species, then perform a gene prediction on the genomes, followed by a functional analysis of each one of the species, we are specifically searching for four CAZy digestive enzymes, then, we will build the phylogenetic trees conducted by these four involved proteins. The goal is to find out whether or not our species have genes related to the bacterial phagocytosis and the relation between them.en
- dc.format.mimetype application/pdf*
- dc.identifier.uri http://hdl.handle.net/10230/59920
- dc.language.iso engca
- dc.rights This is an Open Access article distributed under the terms of the Creative Commons Attribution-NonCommercial-NoDerivs 3.0 licenseca
- dc.rights.accessRights info:eu-repo/semantics/openAccessca
- dc.rights.uri http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/es/ca
- dc.subject.keyword Genòmica comparativaca
- dc.subject.keyword Assemblatge de genomesca
- dc.subject.keyword Anàlisi funcionalca
- dc.subject.keyword Genómica comparativa
- dc.subject.keyword Ensamblaje de genomas
- dc.subject.keyword Análisis funcional
- dc.subject.keyword Comparative genomicsen
- dc.subject.keyword Genome assemblyen
- dc.subject.keyword Functional analysisen
- dc.subject.other Treball de fi de grau – Curs 2022-2023ca
- dc.title Comparative genomics on bacterivorous marine heterotrophic flagellatesca
- dc.type info:eu-repo/semantics/bachelorThesisca