Passat, present i futur de la filogenòmica eucariota : famílies gèniques, convergències i reticulacions

Mostra el registre complet Registre parcial de l'ítem

• dc.contributor.author Ocaña Pallarès, Eduard, 1991-
• dc.contributor.other Ruiz Trillo, Iñaki
• dc.contributor.other Universitat Pompeu Fabra. Departament de Ciències Experimentals i de la Salut
• dc.date.accessioned 2024-03-16T02:33:33Z
• dc.date.available 2024-03-16T02:33:33Z
• dc.date.issued 2020-02-05T16:39:06Z
• dc.date.issued 2021-01-23T00:00:25Z
• dc.date.issued 2020-01-23
• dc.date.modified 2024-03-15T10:57:19Z
• dc.description.abstract La present tesi doctoral se centra, d’una banda, en reconstruir l’evolució de famílies gèniques potencialment relacionades amb determinats events de convergència evolutiva en eucariotes; i d’altra banda, en desenvolupar un marc metodològic que permeti estudiar la rellevància de les reticulacions (transferències horitzontals i fusions gèniques) en l'evolució del contingut gènic en relació a l’origen d’animals i fongs. La filogènia dels gens relacionats amb el reconeixement d’orígens de replicació mostra com l’adaptació convergent al parasitisme ha comportat en molts llinatges la simplificació d’aquest complex multiproteic anteriorment considerat com a constitutiu de la cèl·lula eucariota. La filogènia dels gens relacionats amb l’assimilació del nitrat mostra com la transferència horitzontal ha jugat un paper important en la transmissió de l’autotrofia i l’osmotrofia entre diferents llinatges eucariotes. Finalment, també es manifesten algunes limitacions metodològiques i conceptuals detectades en l'estudi de l'evolució reticular, la superació de les quals és necessària per millorar la nostra comprensió sobre el procés evolutiu.
• dc.description.abstract This thesis is centred, on the one hand, on reconstructing the evolution of gene families that are potentially related to specific cases of convergent evolution in eukaryotes; and on the other hand, on developing a methodological framework that allows us to study the impact of reticulations (horizontal gene transfers and gene fusions) on the evolution of gene content in the context of animal and fungal origins. The phylogenetic history of genes related to the recognition of the origins of replication shows how convergent adaptation to parasitism has led to the simplification of this multiprotein complex, previously believed to be a core component of the eukaryotic cell, in many lineages. The phylogenetic history of nitrate assimilation genes shows how horizontal gene transfer has played an important role in the repeated transmission of autotrophic and osmotrophic lifestyles between different eukaryotic lineages. Finally, we highlight some methodological and conceptual limitations detected in the study of reticulate evolution that must be overcome in order to improve our understanding of the evolutionary process.
• dc.description.abstract Programa de doctorat en Biomedicina
• dc.format 514 p.
• dc.format application/pdf
• dc.format application/pdf
• dc.identifier http://hdl.handle.net/10803/668495
• dc.identifier.uri http://hdl.handle.net/10230/43510
• dc.language.iso cat
• dc.publisher Universitat Pompeu Fabra
• dc.rights ADVERTIMENT. Tots els drets reservats. L'accés als continguts d'aquesta tesi doctoral i la seva utilització ha de respectar els drets de la persona autora. Pot ser utilitzada per a consulta o estudi personal, així com en activitats o materials d'investigació i docència en els termes establerts a l'art. 32 del Text Refós de la Llei de Propietat Intel·lectual (RDL 1/1996). Per altres utilitzacions es requereix l'autorització prèvia i expressa de la persona autora. En qualsevol cas, en la utilització dels seus continguts caldrà indicar de forma clara el nom i cognoms de la persona autora i el títol de la tesi doctoral. No s'autoritza la seva reproducció o altres formes d'explotació efectuades amb finalitats de lucre ni la seva comunicació pública des d'un lloc aliè al servei TDX. Tampoc s'autoritza la presentació del seu contingut en una finestra o marc aliè a TDX (framing). Aquesta reserva de drets afecta tant als continguts de la tesi com als seus resums i índexs.
• dc.rights info:eu-repo/semantics/openAccess
• dc.source TDX (Tesis Doctorals en Xarxa)
• dc.subject.keyword Comparative genomics
• dc.subject.keyword Eukaryotes
• dc.subject.keyword Reticulate evolution
• dc.subject.keyword Convergent evolution
• dc.subject.keyword Phylogenomics
• dc.subject.keyword Genòmica comparada
• dc.subject.keyword Eucariotes
• dc.subject.keyword Evolució reticular
• dc.subject.keyword Evolució convergent
• dc.subject.keyword Filogenòmica
• dc.subject.keyword 575
• dc.title Passat, present i futur de la filogenòmica eucariota : famílies gèniques, convergències i reticulacions
• dc.type info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
• dc.type info:eu-repo/semantics/publishedVersion