Computational studies of DNA damage and repair of alkylating agents and UV light

Mostra el registre complet Registre parcial de l'ítem

• dc.contributor.author Kranas, Hanna
• dc.contributor.other López Bigas, Núria
• dc.contributor.other González-Pérez, Abel
• dc.contributor.other Universitat Pompeu Fabra. Departament de Medicina i Ciències de la Vida
• dc.date.accessioned 2024-03-16T02:34:39Z
• dc.date.available 2024-03-16T02:34:39Z
• dc.date.issued 2023-11-08T18:23:08Z
• dc.date.issued 2023-11-08T18:23:08Z
• dc.date.issued 2023-11-03
• dc.date.modified 2024-03-15T10:57:20Z
• dc.description.abstract Living cells are exposed to naturally occurring DNA-damaging agents that promote the loss of genome integrity, threatening the proper functioning of the cell. To counteract the toxic accumulation of DNA damage, organisms have acquired mechanisms of DNA repair, comprising multiple pathways charged with correcting the different types of damage a genome can accumulate. The aim of this thesis is the study of DNA damage caused by alkylating agents and UV light and their repair. First, we describe the first nucleotide-resolution alkylating damage maps in humans. Second, we present a novel approach to partition the genome by UV DNA damage repair activity aimed at studying the determinants of the UV mutagenic process that is unbiased by genomic features. Both projects contribute to expanding our knowledge of how different parts of DNA damage response interact with chromatin architecture and basic cell processes, like DNA replication or transcription.
• dc.description.abstract Les cèl·lules estan exposades a agents naturals que danyen l’ADN, posant en risc el seu funcionament. Per tal de contrarestar la toxicitat del dany genòmic, els éssers vius han adquirit mecanismes de reparació de l’ADN dedicats a corregir els diferents tipus de dany. L’objectiu d’aquesta tesi és estudiar l’acumulació i reparació del dany genòmic causat pels agents alquilants i la radiació ultraviolada. Primer, descrivim els primers mapes de dany genòmic induït per agents alquilants en humans. A continuació, presentem una nova aproximació per a dividir el genoma en base a la reparació del dany genòmic causat per la radiació ultraviolada amb l’objectiu d’estudiar, de manera no esbiaixada, els determinants mutacionals associats. Tots dos estudis contribueixen a ampliar el coneixement de com l’acumulació de dany genòmic i la seva reparació s’associen amb les característiques de la cromatina i altres processos cel·lulars com la replicació de l’ADN o la transcripció.
• dc.description.abstract Programa de Doctorat en Biomedicina
• dc.format 148 p.
• dc.format application/pdf
• dc.identifier http://hdl.handle.net/10803/689274
• dc.identifier.uri http://hdl.handle.net/10230/58243
• dc.language.iso eng
• dc.publisher Universitat Pompeu Fabra
• dc.rights L'accés als continguts d'aquesta tesi queda condicionat a l'acceptació de les condicions d'ús establertes per la següent llicència Creative Commons: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
• dc.rights http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
• dc.rights info:eu-repo/semantics/openAccess
• dc.source TDX (Tesis Doctorals en Xarxa)
• dc.subject.keyword DNA damage
• dc.subject.keyword DNA repair mechanisms
• dc.subject.keyword Mutagenic processes
• dc.subject.keyword UV radiation
• dc.subject.keyword Alkylating agents
• dc.subject.keyword Dany genètic
• dc.subject.keyword Reparació de l'ADN
• dc.subject.keyword Processos mutagènics
• dc.subject.keyword Radiació ultraviolada
• dc.subject.keyword Alquilació de l’ADN
• dc.subject.keyword 575
• dc.title Computational studies of DNA damage and repair of alkylating agents and UV light
• dc.type info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
• dc.type info:eu-repo/semantics/publishedVersion