Control of transcription initiation by the stress activated hog1 kinase

Mostra el registre complet Registre parcial de l'ítem

• dc.contributor.author Zapater Enrique, Meritxell
• dc.contributor.other Posas Garriga, Francesc
• dc.contributor.other Nadal Clanchet, Eulàlia de
• dc.contributor.other Universitat Pompeu Fabra. Departament de Ciències Experimentals i de la Salut
• dc.date.accessioned 2024-03-16T02:34:07Z
• dc.date.available 2024-03-16T02:34:07Z
• dc.date.issued 2011-04-12T16:28:42Z
• dc.date.issued 2009-07-13
• dc.date.issued 2006-12-01
• dc.date.issued 2009-07-13
• dc.date.modified 2024-03-15T10:57:25Z
• dc.description.abstract En el llevat Saccharomyces cerevisiae els canvis en les condicions osmòtiques del medi extracel.lular són sensades per la MAP cinasa Hog1, la qual permet dur a terme l'adaptació cel.lular mitjançant la modulació de l'expressió gènica, de la traducció i de la progressió del cicle cel.lular. A l'inici d'aquest projecte de tesi, els mecanismes pels quals Hog1 controla l'expressió gènica no eren del tot coneguts. El nostre objectiu va ser caracteritzar el mecanisme molecular pel qual Hog1 modula la transcripció en resposta a estrès osmòtic. Hem aconseguit demostrar que el reclutament de Hog1 als promotors sensibles a estrès osmòtic per part del factor de transcripció és essencial per al reclutament i activació de la RNA polimerasa II, mecanisme que podria estar conservat en les cèl.lules eucariotes. També hem identificat noves activitats remodeladores de cromatina implicades en la resposta gènica a osmoestrès mediada per Hog1. Vàrem realitzar un cribatge genètic per identificar mutacions que provoquessin osmosensibilitat i una reducció en l'expressió de gens de resposta a estrès osmòtic. Aquest cribatge ens va permetre identificar nous reguladors de la transcripció mediada per osmoestrès: la histona deacetilasa Rpd3 i els complexes SAGA i mediador. Els nostres resultats permeten, doncs, definir un important paper per a Rpd3, SAGA i mediador en la inducció gènica mediada per Hog1, i han estat importants per assolir una millor visió de com les cinases activades per estrès regulen la iniciació de la transcripció.
• dc.description.abstract In Saccharomyces cerevisiae, changes in the extracellular osmotic conditions are sensed by the HOG MAPK pathway, which elicits the program for cell adaptation, including modulation of gene expression, translation and cell-cycle progression. At the beginning of this PhD Project, the mechanisms by which Hog1 was controlling gene transcription were not completely understood. Our main objective was to characterize the molecular mechanisms by which the Hog1 MAPK modulates transcription upon osmostress. We have shown that anchoring of Hog1 to osmoresponsive promoters by the transcription factor is essential for recruitment and activation of RNA polymerase II, a mechanism that might be conserved among eukaryotic cells. In addition, we identified novel chromatin modifying and remodelling activities involved in the Hog1-mediated osmostress gene expression. We performed a genome-wide genetic screening searching for mutations that render cells osmosensitive and displayed reduced expression of osmoresponsive genes. Rpd3 histone deacetylase, SAGA and Mediator complexes were identified as novel regulators of osmostress-mediated transcription. Thus, our results define a major role for Rpd3, SAGA and Mediator in the Hog1-mediated osmostress gene induction, and have been important to achieve a better view of how a SAPK regulates transcription initiation.
• dc.description.abstract Programa de doctorat en Biomedicina
• dc.format application/pdf
• dc.format application/pdf
• dc.identifier 9788469248461
• dc.identifier http://www.tdx.cat/TDX-0713109-112447
• dc.identifier http://hdl.handle.net/10803/7149
• dc.identifier B.32335-2009
• dc.identifier.uri http://hdl.handle.net/10230/12148
• dc.language.iso eng
• dc.publisher Universitat Pompeu Fabra
• dc.rights ADVERTIMENT. L'accés als continguts d'aquesta tesi doctoral i la seva utilització ha de respectar els drets de la persona autora. Pot ser utilitzada per a consulta o estudi personal, així com en activitats o materials d'investigació i docència en els termes establerts a l'art. 32 del Text Refós de la Llei de Propietat Intel·lectual (RDL 1/1996). Per altres utilitzacions es requereix l'autorització prèvia i expressa de la persona autora. En qualsevol cas, en la utilització dels seus continguts caldrà indicar de forma clara el nom i cognoms de la persona autora i el títol de la tesi doctoral. No s'autoritza la seva reproducció o altres formes d'explotació efectuades amb finalitats de lucre ni la seva comunicació pública des d'un lloc aliè al servei TDX. Tampoc s'autoritza la presentació del seu contingut en una finestra o marc aliè a TDX (framing). Aquesta reserva de drets afecta tant als continguts de la tesi com als seus resums i índexs.
• dc.rights info:eu-repo/semantics/openAccess
• dc.source TDX (Tesis Doctorals en Xarxa)
• dc.subject.keyword Rpd3 histone deacetylase
• dc.subject.keyword genetic screening
• dc.subject.keyword mediator
• dc.subject.keyword SAGA
• dc.subject.keyword Hot1
• dc.subject.keyword RNA polymerase II
• dc.subject.keyword saccharomyces cerevisiae
• dc.subject.keyword gene transcription
• dc.subject.keyword osmostress
• dc.subject.keyword stress-activated kinase (SAPK)
• dc.subject.keyword MAP kinase
• dc.subject.keyword Hog1
• dc.subject.keyword promotors de resposta a osmoestrès
• dc.subject.keyword immunoprecipitació de cromatina (ChIP)
• dc.subject.keyword osmosensibilitat
• dc.subject.keyword cribatge genètic
• dc.subject.keyword Rpd3 histona deacetilasa
• dc.subject.keyword mediador
• dc.subject.keyword SAGA
• dc.subject.keyword Hot1
• dc.subject.keyword RNA polimerasa II
• dc.subject.keyword saccharomyces cerevisiae
• dc.subject.keyword transcripció gènica
• dc.subject.keyword estrès osmòtic
• dc.subject.keyword cinasa activada per estrès (SAPK)
• dc.subject.keyword MAP cinasa
• dc.subject.keyword Hog1
• dc.subject.keyword osmosensitivity
• dc.subject.keyword chromatin immnunoprecipitation (ChIP)
• dc.subject.keyword osmoresponsive promoters
• dc.subject.keyword 575
• dc.subject.keyword 58
• dc.title Control of transcription initiation by the stress activated hog1 kinase
• dc.type info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
• dc.type info:eu-repo/semantics/publishedVersion