dc.contributor.author |
Martínez Cebrián, Gerard, 1992- |
dc.contributor.other |
Posas Garriga, Francesc |
dc.contributor.other |
Nadal Clanchet, Eulàlia de |
dc.contributor.other |
Universitat Pompeu Fabra. Departament de Ciències Experimentals i de la Salut |
dc.date.accessioned |
2024-03-16T02:34:33Z |
dc.date.available |
2024-03-16T02:34:33Z |
dc.date.issued |
2019-12-03T17:00:45Z |
dc.date.issued |
2020-12-03T00:00:29Z |
dc.date.issued |
2019-12-03 |
dc.identifier |
http://hdl.handle.net/10803/668153 |
dc.identifier.uri |
http://hdl.handle.net/10230/43194 |
dc.description.abstract |
Upon environmental stresses such as temperature fluctuations or increases in osmolarity, yeast
Saccharomyces cerevisiae induces a transcriptional reprograming in order to survive and adapt to
the stress. Histone post-translational modifications are key regulatory elements known to modulate
transcription. By using a complete collection of histone mutants, we performed a high throughput
transcriptional screening to assess the histone residues required for a proper induction of stressresponsive fluorescent reporters upon heat and osmotic stress. From our screening, we could
extract general conclusions regarding the histone residues required for the stress-induced
transcription. We observed poor overlap between the residues necessary for heat and osmotic
stress. Results from the screening also suggested accessible and modifiable residues were more
prone to affect stress-induced transcription when mutated. Following such indications, we selected
the accessible and modifiable residues H4-S47 and H4-T30 as their mutation rendered
transcriptional defects upon osmotic and heat stress respectively. We validated and characterized
the extent of their transcriptional defects by northern blot and RNA sequencing. We also identified
and characterized Cla4 and Ste20 for H4-S47 and Ste11 for the H4-T30 as the putative kinases
phosphorylating these residues upon stress. In addition, the study of other residues identified in
the screening opens new possibilities to identify novel histone modifications relevant for the
transcriptional stress response. |
dc.description.abstract |
Durant estressos ambientals, com ara fluctuacions de temperatura o augment de l'osmolaritat, el
llevat Saccharomyces cerevisiae indueix una reprogramació transcripcional per sobreviure i
adaptar-se a l'estrès. Les modificacions post-traduccionals d'histones són elements reguladors clau
coneguts per modular la transcripció. Utilitzant una col·lecció complet de mutants d'histona, vam
realitzar un cribratge transcripcional a gran escala per a avaluar els residus d'histona necessaris per
a una inducció adequada de senyalitzadors fluorescents que responen a estrès osmòtic i tèrmic. Del
nostre cribratge, vam poder extreure conclusions generals sobre els residus d'histona necessaris
per a la transcripció induïda per estrès. Vam observar poc solapament entre els residus necessaris
per l’estrès tèrmic i osmòtic. Els resultats del cribratge també suggereixen que els residus
accessibles i modificables, quan se’ls mutava, eren més propensos a afectar la transcripció induïda
per l'estrès. Seguint aquestes indicacions, vam seleccionar els residus accessibles i modificables
H4-S47 i H4-T30 ja que la seva mutació proporcionava defectes transcripcionals en estrès osmòtic
i tèrmic respectivament. Vam validar i caracteritzar l’extensió dels seus defectes transcripcionals
mitjançant norther blot i seqüenciació d’ARN. També vam identificar i caracteritzar Cla4 i Ste20
per a H4-S47 i Ste11 per a H4-T30 com a possibles quinases que fosforilen els dos residus en
estrès. A més, l'estudi d'altres residus identificats en el cribratge obre noves possibilitats per
identificar noves modificacions d'histona rellevants per a la resposta transcripcional en estrès. |
dc.description.abstract |
Programa de doctorat en Biomedicina |
dc.format |
183 p. |
dc.format |
application/pdf |
dc.format |
application/pdf |
dc.language.iso |
eng |
dc.publisher |
Universitat Pompeu Fabra |
dc.rights |
ADVERTIMENT. L'accés als continguts d'aquesta tesi doctoral i la seva utilització ha de respectar els drets de la persona autora. Pot ser utilitzada per a consulta o estudi personal, així com en activitats o materials d'investigació i docència en els termes establerts a l'art. 32 del Text Refós de la Llei de Propietat Intel·lectual (RDL 1/1996). Per altres utilitzacions es requereix l'autorització prèvia i expressa de la persona autora. En qualsevol cas, en la utilització dels seus continguts caldrà indicar de forma clara el nom i cognoms de la persona autora i el títol de la tesi doctoral. No s'autoritza la seva reproducció o altres formes d'explotació efectuades amb finalitats de lucre ni la seva comunicació pública des d'un lloc aliè al servei TDX. Tampoc s'autoritza la presentació del seu contingut en una finestra o marc aliè a TDX (framing). Aquesta reserva de drets afecta tant als continguts de la tesi com als seus resums i índexs. |
dc.rights |
info:eu-repo/semantics/openAccess |
dc.source |
TDX (Tesis Doctorals en Xarxa) |
dc.title |
Identification of novel histone marks required for the transcriptional stress response |
dc.type |
info:eu-repo/semantics/doctoralThesis |
dc.type |
info:eu-repo/semantics/publishedVersion |
dc.date.modified |
2024-03-15T10:57:24Z |
dc.subject.keyword |
Histones |
dc.subject.keyword |
Transcription |
dc.subject.keyword |
Stress |
dc.subject.keyword |
Kinases |
dc.subject.keyword |
Histones |
dc.subject.keyword |
Transcripció |
dc.subject.keyword |
Estrès |
dc.subject.keyword |
Modificacions post-traduccionals |
dc.subject.keyword |
Post-translational modifications |
dc.subject.keyword |
Quinases |
dc.subject.keyword |
577 |