Welcome to the UPF Digital Repository

A Screen for novel factors involved in pluripotency and X-chromosome reactivation

Show simple item record

dc.contributor.author Generoso, Serena Francesca, 1988-
dc.contributor.other Payer, Bernhard
dc.contributor.other Universitat Pompeu Fabra. Departament de Ciències Experimentals i de la Salut
dc.date.accessioned 2019-04-04T01:23:30Z
dc.date.available 2019-04-04T01:23:30Z
dc.date.issued 2019-03-21
dc.date.issued info:eu-repo/date/embargoEnd/2021-03-21
dc.identifier http://hdl.handle.net/10803/666581
dc.identifier.uri http://hdl.handle.net/10230/37035
dc.description.abstract X-Chromosome Reactivation (XCR) occurs in the epiblast cells of the blastocyst and in germ cells, thereby coupling XCR with pluripotency. We performed a screen in iPS cells by knocking down the expression of candidate genes picked from a single cell microarray expression profile in blastocysts. We thereby identified candidates which had an effect on both pluripotency and X-Reactivation. However, we also identified factors with a specific role in XCR. This suggests that XCR is not an absolute requirement for iPSC reprogramming and that the two processes can be uncoupled. Among these factors, there was the cohesin complex member Smc1a. In experiments based on Super resolution microscopy (STORM), we observed a preferential enrichment of Smc1a on the active compared to inactive X, suggesting a role in shaping the Xa structure. Therefore, we conclude that cohesin-mediated changes in X-chromosome structure are a key step during the XCR process.
dc.description.abstract La reactivación del cromosoma X (XCR) ocurre en las células epiblásticas del blastocisto y en las células germinales, acoplando XCR con la pluripotencia. Se realizó un cribaje durante la reprogramación de iPSC reduciendo la expresión de genes candidatos, seleccionados a partir de un microarray de expresión en blastocitos. Se identificaron factores con un efecto tanto en la pluripotencia como en la XCR y factores con un rol específico en la XCR. Esto sugiere que la XCR no es un requisito absoluto para la reprogramación de las iPSC, y que los dos procesos se pueden desacoplar. Se identificó el miembro Smc1a del complejo de cohesina. Mediante microscopía de súper resolución (STORM) se observó un enriquecimiento preferencial de Smc1a en el cromosoma X activo en comparación con el X inactivo, lo que sugiere un papel en la configuración de la estructura del X activo. Por lo tanto, concluimos que los cambios mediados por cohesina en la estructura del cromosoma X son un paso clave durante el proceso de XCR.
dc.format application/pdf
dc.format 197 p.
dc.language.iso eng
dc.publisher Universitat Pompeu Fabra
dc.rights ADVERTIMENT. L'accés als continguts d'aquesta tesi doctoral i la seva utilització ha de respectar els drets de la persona autora. Pot ser utilitzada per a consulta o estudi personal, així com en activitats o materials d'investigació i docència en els termes establerts a l'art. 32 del Text Refós de la Llei de Propietat Intel·lectual (RDL 1/1996). Per altres utilitzacions es requereix l'autorització prèvia i expressa de la persona autora. En qualsevol cas, en la utilització dels seus continguts caldrà indicar de forma clara el nom i cognoms de la persona autora i el títol de la tesi doctoral. No s'autoritza la seva reproducció o altres formes d'explotació efectuades amb finalitats de lucre ni la seva comunicació pública des d'un lloc aliè al servei TDX. Tampoc s'autoritza la presentació del seu contingut en una finestra o marc aliè a TDX (framing). Aquesta reserva de drets afecta tant als continguts de la tesi com als seus resums i índexs.
dc.rights info:eu-repo/semantics/openAccess
dc.source TDX (Tesis Doctorals en Xarxa)
dc.title A Screen for novel factors involved in pluripotency and X-chromosome reactivation
dc.type info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
dc.type info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.date.modified 2019-04-02T16:10:10Z
dc.subject.keyword Screen
dc.subject.keyword Pluripotency
dc.subject.keyword Cell reprogramming
dc.subject.keyword X-Reactivation
dc.subject.keyword X-Chromosome structure
dc.subject.keyword Cribaje
dc.subject.keyword Pluripotencia
dc.subject.keyword Reprogramación celular
dc.subject.keyword Reactivación del X
dc.subject.keyword Estructura del cromosoma X
dc.subject.keyword 577


Files in this item

Files Size Format View

There are no files associated with this item.

This item appears in the following Collection(s)

Show simple item record

Search DSpace


Advanced Search

Browse

My Account

Statistics

Compliant to Partaking