Welcome to the UPF Digital Repository

A dynamic Turing model of digit patterning : a Turing mechanism modulated by positional information underlies digit specification

Show simple item record

dc.contributor.author Marcon, Luciano, 1983-
dc.contributor.other Sharpe, James
dc.contributor.other Universitat Pompeu Fabra. Departament de Ciències Experimentals i de la Salut
dc.date.accessioned 2017-09-27T01:32:12Z
dc.date.available 2017-09-27T01:32:12Z
dc.date.issued 2013-11-05
dc.identifier B 15294-2015
dc.identifier http://hdl.handle.net/10803/293259
dc.identifier.uri http://hdl.handle.net/10230/23695
dc.description.abstract The specification of the vertebrate limb skeleton is a classical model to study pattern formation during development. Two different theories have been proposed to explain this process: the Turing mechanism and the Positional Information model. This thesis uses computational modeling to explores to which extent these two theories can be combined to explain digit patterning. The main result of this work is a computational model of digit patterning that suggests that a Turing mechanism modulated by Hox genes and Fgf-signaling underlies digit specification. By comparing simulations and experimental data we show that the Turing mechanism is implemented by Bmps, Sox9 and Wnts. The model shows that a combination of Positional Information and Turing can implement an extremely reliable patterning mechanism and suggests that Fgf-singling coordinates patterning and growth
dc.description.abstract L'especificació de l'esquelet de las extremitats dels vertebrats és un model clàssic per estudiar la formació de patróns durant el desenvolupament. Dues diferents teories van propusarse per explicar aquest procés: el mecanisme de reacció-difusió de Turing i el model de Positional Information. Aquesta tesi utilitza modelos computacionals per explorar si aquestas dues teories es poden combinar per explicar el patron dels dits. El resultat principal és un model computacional que suggereix que un mecanisme de Turing modulat per Hox genes i Fgfs controla l'especificació dels dits. Comparant simulacions amb dades experimentals aconseguim demostrar que el mecanisme de Turing és implementat per Bmps, Sox9 i Wnts. A mes, el model mostra que una combinació de un mecanisme de Turing i Positional Information aconsegueix especificar al patró de manera extremadament fiable i suggereix que els Fgfs coordinen la formació del patró amb el creixement.
dc.format application/pdf
dc.format 253 p.
dc.language.iso eng
dc.publisher Universitat Pompeu Fabra
dc.rights ADVERTIMENT. L'accés als continguts d'aquesta tesi doctoral i la seva utilització ha de respectar els drets de la persona autora. Pot ser utilitzada per a consulta o estudi personal, així com en activitats o materials d'investigació i docència en els termes establerts a l'art. 32 del Text Refós de la Llei de Propietat Intel·lectual (RDL 1/1996). Per altres utilitzacions es requereix l'autorització prèvia i expressa de la persona autora. En qualsevol cas, en la utilització dels seus continguts caldrà indicar de forma clara el nom i cognoms de la persona autora i el títol de la tesi doctoral. No s'autoritza la seva reproducció o altres formes d'explotació efectuades amb finalitats de lucre ni la seva comunicació pública des d'un lloc aliè al servei TDX. Tampoc s'autoritza la presentació del seu contingut en una finestra o marc aliè a TDX (framing). Aquesta reserva de drets afecta tant als continguts de la tesi com als seus resums i índexs.
dc.rights info:eu-repo/semantics/openAccess
dc.source TDX (Tesis Doctorals en Xarxa)
dc.title A dynamic Turing model of digit patterning : a Turing mechanism modulated by positional information underlies digit specification
dc.type info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
dc.type info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.date.modified 2017-09-25T02:56:02Z
dc.subject.keyword Limb development
dc.subject.keyword Positional information
dc.subject.keyword Reaction-difussion
dc.subject.keyword Turing mechanism
dc.subject.keyword Digit patterning
dc.subject.keyword Scale invariance
dc.subject.keyword Bmp
dc.subject.keyword Sox9
dc.subject.keyword Wnt
dc.subject.keyword Desenvolupament de les extremitats
dc.subject.keyword Informació de posició
dc.subject.keyword Reacció-difusió
dc.subject.keyword Mecanisme de Turing
dc.subject.keyword Patró dels dits
dc.subject.keyword Invariànça d'escala
dc.subject.keyword 79


Files in this item

Files Size Format View

There are no files associated with this item.

This item appears in the following Collection(s)

Show simple item record

Search DSpace


Advanced Search

Browse

My Account

Statistics

Compliant to Partaking