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Examinant per Autoria "Hermoso Pulido, Antonio"

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    An atlas of alternative splicing profiles and functional associations reveals new regulatory programs and genes that simultaneously express multiple major isoforms

    (Cold Spring Harbor Laboratory Press (CSHL Press), 2017) Tapial Rodríguez, Javier, 1990-; Ha, Kevin C. H.; Sterne-Weiler, Thimothy; Gohr, André; Braunschweig, Ulrich; Hermoso Pulido, Antonio; Quesnel-Vallières, Mathieu; Permanyer, Jon; Sodaei, Reza, 1988-; Marquez, Yamile; Cozzuto, Luca; Wang, Xinchen; Gómez-Velázquez, Melisa; Rayon, Teresa; Manzanares, Miguel; Ponomarenko, Julia; Blencowe, Benjamin J.; Irimia Martínez, Manuel

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    Bioinformatics and moonlighting proteins

    (Frontiers, 2015) Hernández, Sergi; Franco, Luís; Calvo Vidal, Verónica Alejandra; Ferragut, Gabriela; Hermoso Pulido, Antonio; Amela, Isaac; Gómez, Antonio; Querol, Enrique; Cedano, Juan

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    Can bioinformatics help in the identification of moonlighting proteins?

    (Portland Press, 2014) Hernández, Sergi; Franco, Luís; Calvo Vidal, Verónica Alejandra; Ferragut, Gabriela; Hermoso Pulido, Antonio; Amela, Isaac; Gómez, Antonio; Querol, Enrique; Cedano, Juan

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    Citizen science charts two major "stomatotypes" in the oral microbiome of adolescents and reveals links with habits and drinking water composition

    (BioMed Central, 2018) Willis, Jesse R.; González-Torres, Pedro; Pittis, Alexandros, 1982-; Bejarano, Luis A.; Cozzuto, Luca; Andreu Somavilla, Núria; Alloza-Trabado, Miriam; Valentín, Antònia; Ksiezopolska, Ewa; Company, Carlos; Onywera, Harris; Montfort, Magda; Hermoso Pulido, Antonio; Iraola Guzmán, Susana; Saus Martínez, Ester; Labeeuw, Annick; Carolis, Carlo; Hecht, Jochen; Ponomarenko, Julia; Gabaldón Estevan, Juan Antonio, 1973-

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    ExOrthist: a tool to infer exon orthologies at any evolutionary distance

    (BioMed Central, 2021) Márquez, Yamile; Mantica, Federica; Cozzuto, Luca; Burguera, Demián; Hermoso Pulido, Antonio; Ponomarenko, Julia; Roy, Scott W.; Irimia Martínez, Manuel

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    FA-nf: a functional annotation pipeline for proteins from non-model organisms implemented in nextflow

    (MDPI, 2021) Vlasova, Anna; Hermoso Pulido, Antonio; Camara, Francisco; Ponomarenko, Julia; Guigó Serra, Roderic

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    From research to rapid response: mass COVID-19 testing by volunteers at the Centre for Genomic Regulation

    (F1000Research, 2020) Ghose, Ritobrata; Aranguren-Ibáñez, Álvaro; Arecco, Niccolò; Balboa, Diego; Bataller, Marc; Beltran, Sergi; Benisty, Hannah, 1986-; Bénard, Angèle; Bernardo, Edgar; Carbonell Sala, Silvia; Casals, Eloi; Ciampi, Ludovica; Condemi, Livia; Corvò, Alberto; Cosín Tomàs, Marta; Cuenca-Ardura, Mirabai; Duran Serrano, Juan Manuel; Espejo Díaz, María Isabel; Fernández Callejo, Marcos; Gañez-Zapater, Antoni; Garcia-Castellanos, Raquel; Garrido, Romina; Henkin, Gil; Hermoso Pulido, Antonio; Hernandez-Alias, Xavier; Herrero Vicente, Jorge; Ingham, Matthew; Lim, Wei Ming; Llonch, Sílvia; Marmesat Bertoli, Elena; Miguel Escalada, Irene; Montero-Blay, Ariadna, 1994-; Navarrete Hernández, Cristina; Neguembor, Maria Victoria; Ní Chárthaigh, Róisín-Ana; Pardo-Lorente, Natalia; Pascual-Reguant, Laura, 1990-; Pérez-Lluch, Sílvia; Perza, Reyes; Pesaresi, Martina, 1991-; Picó Amado, Daniel; Pifarré, Paula; Piscia, Davide; Plana-Carmona, Marcos; Ponomarenko, Julia; Radusky, Leandro; Rivero, Ezequiel; Rogalska, Malgorzata; Torcal Garcia, Guillem, 1991-; Wojnacki, José

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    Genome-wide transcriptomic changes reveal the genetic pathways involved in insect migration

    (Wiley, 2022) Doyle, Toby; Jiménez Guri, Eva; Hawkes, Will L.S.; Massy, Richard; Mantica, Federica; Permanyer, Jon; Cozzuto, Luca; Hermoso Pulido, Antonio; Baril, Tobias; Hayward, Alexander; Irimia Martínez, Manuel; Chapman, Jason W.; Bass, Chris; Wotton, Karl R.

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    GREENC: a Wiki-based database of plant lncRNAs

    (Oxford University Press, 2016) Paytuví Gallart, Andreu; Hermoso Pulido, Antonio; Anzar Martínez de Lagrán, Irantzu; Sanseverino, Walter; Aiese Cigliano, Riccardo

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    LncATLAS database for subcellular localization of long noncoding RNAs

    (Cold Spring Harbor Laboratory Press (CSHL Press), 2017) Mas Ponte, David; Carlevaro-Fita, Joana; Palumbo, Emilio; Hermoso Pulido, Antonio; Guigó Serra, Roderic; Johnson, Rory

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    MasterOfPores: A workflow for the analysis of Oxford nanopore direct RNA sequencing datasets

    (Frontiers Media, 2020) Cozzuto, Luca; Liu, Huanle; Pryszcz, Leszek Piotr, 1985-; Hermoso Pulido, Antonio; Delgado-Tejedor, Anna; Ponomarenko, Julia; Novoa, Eva Maria

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    MyMpn: a database for the systems biology model organism Mycoplasma pneumoniae

    (Oxford University Press, 2015) Wodke, Judith A.H.; Alibés, Andreu; Cozzuto, Luca; Hermoso Pulido, Antonio; Yus, Eva; Lluch-Senar, Maria 1982-; Serrano Pubull, Luis, 1982-; Roma, Guglielmo

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    Nanopore direct RNA sequencing data processing and analysis using MasterOfPores

    (Springer, 2023) Cozzuto, Luca; Delgado-Tejedor, Anna; Hermoso Pulido, Antonio; Novoa, Eva Maria; Ponomarenko, Julia

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    Pergola-web: a web server for the visualization and analysis of longitudinal behavioral data using repurposed genomics tools and standards

    (Oxford University Press, 2019) Espinosa-Carrasco, José; Hermoso Pulido, Antonio; Erb, Ionas; Dierssen, Mara; Ponomarenko, Julia; Notredame, Cedric

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    Pergola: boosting visualization and analysis of longitudinal data by unlocking genomic analysis tools

    (Elsevier, 2018) Espinosa-Carrasco, José; Erb, Ionas; Hermoso Pulido, Antonio; Ponomarenko, Julia; Dierssen, Mara; Notredame, Cedric

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    PRGdb 2.0: towards a community-based database model for the analysis of R-genes in plants

    (Oxford University Press, 2013) Sanseverino, Walter; Hermoso Pulido, Antonio; D’Alessandro, Raffaella; Vlasova, Anna; Andolfo, Giuseppe; Frusciante, Luigi; Lowy Gallego, Ernesto; Roma, Guglielmo; Ercolano, Maria Raffaella

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    QCloud2: an improved cloud-based quality-control system for mass-spectrometry-based proteomics laboratories

    (American Chemical Society (ACS), 2021) Olivella, Roger; Chiva, Cristina; Serret, Marc; Mancera, Daniel; Cozzuto, Luca; Hermoso Pulido, Antonio; Borràs, Eva; Espadas, Guadalupe; Morales Sanfrutos, Julia; Pastor, Olga; Solé, Amanda; Ponomarenko, Julia; Sabidó Aguadé, Eduard, 1981-

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    Scalable Design of Paired CRISPR Guide RNAs for Genomic Deletion

    (Public Library of Science (PLoS), 2017) Pulido-Quetglas, Carlos; Aparicio i Prat, Estel, 1986-; Arnan Ros, Carme; Polidori, Taisia; Hermoso Pulido, Antonio; Palumbo, Emilio; Ponomarenko, Julia; Guigó Serra, Roderic; Johnson, Rory

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    SuperFly: a comparative database for quantified spatio-temporal gene expression patterns in early dipteran embryos

    (Oxford University Press, 2015) Cicin Sain, Damjan; Hermoso Pulido, Antonio; Crombach, Anton; Wotton, Karl R.; Jiménez Guri, Eva; Taly, Jean-François; Roma, Guglielmo; Jaeger, Johannes, 1973-

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    Whole genome sequencing of turbot (Scophthalmus maximus; Pleuronectiformes): a fish adapted to demersal life

    (Oxford University Press, 2016) Figueras, Antonio; Corvelo, André; Gómez Garrido, Jèssica; Gut, Marta; Gut, Ivo Glynne; Marcet Houben, Marina; Vlasova, Anna; Hermoso Pulido, Antonio; Guigó Serra, Roderic; Gabaldón Estevan, Juan Antonio, 1973-; Alioto, Tyler; Martínez, Paulino

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