Contribution of unexplored genomic variations to neurodevelopmental disorders

López Sánchez, Marcos

Contribution of unexplored genomic variations to neurodevelopmental disorders

Tipus de document

Tesi doctoral
Versió publicada

Autoria

López Sánchez, Marcos

Director/a

González Ruiz, Juan Ramón
Pérez Jurado, Luis Alberto

Data de publicació

2018-02-05

Pàgines

197 p.

Llicència

Citació

López Sánchez, M. Contribution of unexplored genomic variations to neurodevelopmental disorders. Universitat Pompeu Fabra; 2018. handle: http://hdl.handle.net/10803/663913

Aquesta citació s'ha generat automàticament.

Programa de doctorat

Programa de doctorat en Biomedicina

Resum

Neurodevelopmental disorders are a group of conditions with impairments of the personal, social, academic or occupational behaviour. Autism spectrum disorder is a neurodevelopmental disorder with a high genetic component with a large fraction still unknown. In this dissertation we analyse two unexplored genomic variants: Chromosomal mosaicism and Ancestral polymorphic inversions. Chromosomal mosaic events are responsible for a small but significant proportion of patients with ASD (0.45%), with the additional detection of two loss of chromosome Y events. In addition, we developed a bioinformatic tool that improves previous methods to detect loss of chromosome Y: MADloy. In the study of ancestral polymorphic inversions, inv8p23.1 and inv17q21.31 inversions were associated with autism risk. Improvements on the method to genotype ancestral polymorphic inversions allowed the prediction of a novel inversion in 22q11.21 region which has been validated by fiber-FISH.
Els trastorns del neurodesenvolupament son un grup de condicions amb discapacitats conductuals en els àmbits personals, socials, acadèmics o ocupacionals. Els trastorns d’espectre autista són un trastorn del neurodesenvolupament amb una gran component genètica, part de la qual encara es desconeguda. En aquest treball analitzem dues variants genòmiques poc explorades: els reordenaments cromosòmics en mosaic I les inversions ancestrals polimòrfiques. Els reordenaments cromosòmics en Mosaic son responsables d’una significant però petita proporció dels pacients amb trastorn d’espectre autista (0.45%), amb la detecció addicional de dues pèrdues del cromosoma Y. Addicionalment, s’ha desenvolupat una eina bioinformàtica que millora els mètodes previs per detectar la pèrdua de cromosoma Y: MADloy. En l’estudi de les inversions ancestrals polimòrfiques, les inversions inv8p23.1 i inv17q21.31 s’han associat amb el risc d’autisme. Millores en el mètode de genotipació de les inversions ha permès la predicció de una nova inversió localitzada a la regió 22q11.21 que s’ha validat per fiber-FISH.