Micro RNA-Mediated regulation of the full-length and truncated isoforms of human neurotrophic tyrosine kinase receptor type 3 (NTRK 3)
Mostra el registre complet Registre parcial de l'ítem
- dc.contributor.author Guidi, Mònica
- dc.contributor.other Espinosa Parrilla, Yolanda
- dc.contributor.other Estivill, Xavier
- dc.contributor.other Universitat Pompeu Fabra. Departament de Ciències Experimentals i de la Salut
- dc.date.accessioned 2024-03-16T02:33:19Z
- dc.date.available 2024-03-16T02:33:19Z
- dc.date.issued 2011-04-12T16:28:16Z
- dc.date.issued 2009-02-09
- dc.date.issued 2009-01-13
- dc.date.issued 2009-02-09
- dc.date.modified 2024-03-15T10:57:34Z
- dc.description.abstract Neurotrophins and their receptors are key molecules in the development of the<br/>nervous system. Neurotrophin-3 binds preferentially to its high-affinity receptor<br/>NTRK3, which exists in two major isoforms in humans, the full-length kinaseactive<br/>form (150 kDa) and a truncated non-catalytic form (50 kDa). The two<br/>variants show different 3'UTR regions, indicating that they might be differentially<br/>regulated at the post-transcriptional level. In this work we explore how<br/>microRNAs take part in the regulation of full-length and truncated NTRK3,<br/>demonstrating that the two isoforms are targeted by different sets of microRNAs.<br/>We analyze the physiological consequences of the overexpression of some of the<br/>regulating microRNAs in human neuroblastoma cells. Finally, we provide<br/>preliminary evidence for a possible involvement of miR-124 - a microRNA with no<br/>putative target site in either NTRK3 isoform - in the control of the alternative<br/>spicing of NTRK3 through the downregulation of the splicing repressor PTBP1.
- dc.description.abstract Las neurotrofinas y sus receptores constituyen una familia de factores cruciales<br/>para el desarrollo del sistema nervioso. La neurotrofina 3 ejerce su función<br/>principalmente a través de una unión de gran afinidad al receptor NTRK3, del cual<br/>se conocen dos isoformas principales, una larga de 150KDa con actividad de tipo<br/>tirosina kinasa y una truncada de 50KDa sin dicha actividad. Estas dos isoformas<br/>no comparten la misma región 3'UTR, lo que sugiere la existencia de una<br/>regulación postranscripcional diferente. En el presente trabajo se ha explorado<br/>como los microRNAs intervienen en la regulación de NTRK3, demostrando que las<br/>dos isoformas son reguladas por diferentes miRNAs. Se han analizado las<br/>consecuencias fisiológicas de la sobrexpresión de dichos microRNAs utilizando<br/>células de neuroblastoma. Finalmente, se ha estudiado la posible implicación del<br/>microRNA miR-124 en el control del splicing alternativo de NTRK3 a través de la<br/>regulación de represor de splicing PTBP1.
- dc.description.abstract Programa de doctorat en Biomedicina
- dc.format application/pdf
- dc.format application/pdf
- dc.identifier 9788469216972
- dc.identifier http://www.tdx.cat/TDX-0209109-131109
- dc.identifier http://hdl.handle.net/10803/7114
- dc.identifier B.8847-2009
- dc.identifier.uri http://hdl.handle.net/10230/12261
- dc.language.iso eng
- dc.publisher Universitat Pompeu Fabra
- dc.rights ADVERTIMENT. L'accés als continguts d'aquesta tesi doctoral i la seva utilització ha de respectar els drets de la persona autora. Pot ser utilitzada per a consulta o estudi personal, així com en activitats o materials d'investigació i docència en els termes establerts a l'art. 32 del Text Refós de la Llei de Propietat Intel·lectual (RDL 1/1996). Per altres utilitzacions es requereix l'autorització prèvia i expressa de la persona autora. En qualsevol cas, en la utilització dels seus continguts caldrà indicar de forma clara el nom i cognoms de la persona autora i el títol de la tesi doctoral. No s'autoritza la seva reproducció o altres formes d'explotació efectuades amb finalitats de lucre ni la seva comunicació pública des d'un lloc aliè al servei TDX. Tampoc s'autoritza la presentació del seu contingut en una finestra o marc aliè a TDX (framing). Aquesta reserva de drets afecta tant als continguts de la tesi com als seus resums i índexs.
- dc.rights info:eu-repo/semantics/openAccess
- dc.source TDX (Tesis Doctorals en Xarxa)
- dc.subject.keyword RISC complex
- dc.subject.keyword retinoic acid
- dc.subject.keyword renilla luciferase
- dc.subject.keyword real-time quantitative PCR
- dc.subject.keyword PTBP1
- dc.subject.keyword pri-miRNA
- dc.subject.keyword pre-miRNA
- dc.subject.keyword post-transcriptional regulation
- dc.subject.keyword piRNA
- dc.subject.keyword PicTar
- dc.subject.keyword pGL4.13
- dc.subject.keyword PCR
- dc.subject.keyword P-body
- dc.subject.keyword p75NTR
- dc.subject.keyword overexpression
- dc.subject.keyword NTRK3
- dc.subject.keyword NTRK2
- dc.subject.keyword NTRK1
- dc.subject.keyword non-coding RNAs
- dc.subject.keyword NGF
- dc.subject.keyword neurotrophin
- dc.subject.keyword neurotrophic signaling
- dc.subject.keyword neuronal differentiation
- dc.subject.keyword neurodevelopment
- dc.subject.keyword neuroblastoma
- dc.subject.keyword nervous system
- dc.subject.keyword mRNA
- dc.subject.keyword miRNA target prediction
- dc.subject.keyword miRNA profiling
- dc.subject.keyword miRNA mimic
- dc.subject.keyword miRNA microarray
- dc.subject.keyword miRNA inhibitor
- dc.subject.keyword miRanda
- dc.subject.keyword microRNA
- dc.subject.keyword microarray
- dc.subject.keyword luciferase assay
- dc.subject.keyword Ingenuity Pathway Analysis (IPA)
- dc.subject.keyword heLa cells
- dc.subject.keyword gene silencing
- dc.subject.keyword gene regulation
- dc.subject.keyword full-length isoform (FL-NTRK3)
- dc.subject.keyword firefly luciferase
- dc.subject.keyword ERK
- dc.subject.keyword disease
- dc.subject.keyword dicer
- dc.subject.keyword cancer development
- dc.subject.keyword BDNF
- dc.subject.keyword argonaute
- dc.subject.keyword alternative splicing
- dc.subject.keyword 3'UTR
- dc.subject.keyword RNAhybrid
- dc.subject.keyword RT-PCR
- dc.subject.keyword SH-SY5Y cells
- dc.subject.keyword siRNA
- dc.subject.keyword standard error
- dc.subject.keyword synaptic plasticity
- dc.subject.keyword target validation
- dc.subject.keyword TargetScan
- dc.subject.keyword transfection
- dc.subject.keyword translational repression
- dc.subject.keyword TrkA
- dc.subject.keyword TrkB
- dc.subject.keyword TrkC
- dc.subject.keyword truncated isoform (TR-NTRK3)
- dc.subject.keyword tyrosine kinase (TK)
- dc.subject.keyword western blot
- dc.subject.keyword 577
- dc.title Micro RNA-Mediated regulation of the full-length and truncated isoforms of human neurotrophic tyrosine kinase receptor type 3 (NTRK 3)
- dc.type info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
- dc.type info:eu-repo/semantics/publishedVersion