Bioinformatic analysis of epigenetic regulatory mechanisms in development and disease

Mostra el registre complet Registre parcial de l'ítem

• dc.contributor.author González Ramírez, Mar
• dc.contributor.other Di Croce, Luciano
• dc.contributor.other Blanco García, Enrique
• dc.contributor.other Universitat Pompeu Fabra. Departament de Ciències Experimentals i de la Salut
• dc.date.accessioned 2024-10-19T01:35:54Z
• dc.date.available 2024-10-19T01:35:54Z
• dc.date.issued 2021-04-09T15:29:58Z
• dc.date.issued 2023-03-19T23:45:30Z
• dc.date.issued 2021-03-19
• dc.date.modified 2024-10-03T03:45:12Z
• dc.description.abstract Appropriate regulation of gene expression is necessary for correct development and homeostasis of organisms. Epigenetic mechanisms represent an additional layer of information, besides the genetic sequence, crucial for the correct functioning of each cell. Histone modifications, which modulate and are associated to transcriptional activation or repression, are a major epigenetic feature. Thanks to predictive modelling, we have studied which histone modifications relate better to enhancer or promoter function in mouse embryonic stem cells, during differentiation and in animal development. We have found that different histone modifications relate better to enhancers or promoters, respectively. We have studied the role of poised enhancers during differentiation and development. We have seen that poised enhancer activation is not exclusive of the neural lineage, but a general mechanism implicated in differentiation of every cell type. We have characterized the epigenetic landscape of Cushing’s syndrome. We have found persistent epigenetic and transcriptional alterations after long-term remission of the disease, related to a deep alteration of the circadian rhythm. These findings promise to be relevant for future therapeutic advances.
• dc.description.abstract Una regulació apropiada de l’expressió gènica és necessària per a un correcte desenvolupament i homeòstasi dels organismes. Els mecanismes epigenètics representen una informació addicional, a més de la seqüència genètica, crucial per al correcte funcionament de cada cèl·lula. Les modificacions d’histones, que modulen i s’associen a activació o repressió transcripcionals, són una característica epigenètica important. Gràcies al modelatge predictiu, hem estudiat quines modificacions d’histones es relacionen millor amb la funció dels enhancers o promotors en cèl·lules mare embrionàries de ratolí, durant la diferenciació i en el desenvolupament animal. Hem trobat que modificacions d’histones diferents es relacionen millor amb enhancers o promotors, respectivament. Hem estudiat el rol dels poised enhancers durant la diferenciació i el desenvolupament. Hem vist que l’activació dels poised enhancers no és exclusiva del llinatge neural, sinó un mecanisme implicat en la diferenciació de tot tipus cel·lular. Hem caracteritzat el paisatge epigenètic de la síndrome de Cushing. Hem trobat alteracions epigenètiques i transcripcionals després d’una remissió de la malaltia a llarg termini, relacionades amb una profunda alteració del ritme circadiari. Aquestes troballes prometen ser rellevants per a futurs avenços terapèutics.
• dc.description.abstract Programa de doctorat en Biomedicina
• dc.format 252 p.
• dc.format application/pdf
• dc.format application/pdf
• dc.identifier http://hdl.handle.net/10803/671370
• dc.identifier.uri http://hdl.handle.net/10230/47081
• dc.language.iso eng
• dc.rights L'accés als continguts d'aquesta tesi queda condicionat a l'acceptació de les condicions d'ús establertes per la següent llicència Creative Commons: http://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/
• dc.rights http://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/
• dc.rights info:eu-repo/semantics/openAccess
• dc.source TDX (Tesis Doctorals en Xarxa)
• dc.subject.keyword Keywords: epigenetics, poised enhancers, mouse embryonic stem cells, development, Cushing’s syndrome. Paraules clau: epigenètica, poised enhancers, cèl·lules mare embrionàries de ratolí, desenvolupament, Síndrome de Cushing
• dc.subject.keyword Epigenetics
• dc.subject.keyword Poised enhancers
• dc.subject.keyword Mouse embryonic stem cells
• dc.subject.keyword Development
• dc.subject.keyword Cushing's syndrome
• dc.subject.keyword Epigenètica
• dc.subject.keyword Cél.lules mare embrionàries de ratolí
• dc.subject.keyword Síndrome de Cushing
• dc.subject.keyword 573
• dc.title Bioinformatic analysis of epigenetic regulatory mechanisms in development and disease
• dc.type info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
• dc.type info:eu-repo/semantics/publishedVersion