Gene families and the origins of complexity: a comparative genomics approach to better understand multicellularity

Enllaç permanent

Descripció

  • Resum

    L'aparició d'organismes pluricel·lulars complexos planteja infinites preguntes en l'àmbit de la biologia evolutiva, especialment pel que fa als complicats mecanismes reguladors subjacents a la transició d'organismes unicel·lulars a entitats multicel·lulars complexes. Entre els factors fonamentals que impulsen l'evolució de la vida pluricel·lular, cal destacar l'aparició i diversificació de famílies de gens, com els factors de transcripció homeobox, que són clau en el desenvolupament i l'evolució dels animals. En la nostra recerca sobre la trajectòria evolutiva cap a la multicel·lularitat, ens centrem en l'anàlisi d'algunes famílies de gens homeobox utilitzant un bon repositori de genomes i transcriptomes complets al nostre abast, i fem una exhaustiva anàlisi genòmica comparativa mitjançant eines bioinformàtiques especialitzades, en un conjunt de dades que inclou una amplia mostra de taxons d'holozoa, cosa que encara no s'ha fet.
    La aparición de organismos multicelulares complejos plantea infinitas preguntas dentro del ámbito de la biología evolutiva, particularmente en relación con los complicados mecanismos reguladores que subyacen a la transición de organismos unicelulares a entidades multicelulares complejas. Entre los factores fundamentales que impulsan la evolución de la vida multicelular, cabe destacar la aparición y diversificación de familias de genes, como los factores de transcripción homeobox, que son clave en el desarrollo y la evolución animal. En nuestra investigación sobre la trayectoria evolutiva hacia la multicelularidad, nos centramos en el análisis de algunas familias de genes homeobox utilizando un buen repositorio de genomas y transcriptomas completos a nuestra disposición, y realizamos un análisis genómico comparativo exhaustivo utilizando herramientas bioinformáticas especializadas, sobre un conjunto de datos que incluye un amplio muestreo de taxones de Holozoa, algo que aún no se ha hecho.
    The emergence of complex multicellular organisms raises infinite questions within the realm of evolutionary biology, particularly regarding the complicated regulatory mechanisms underlying the transition from unicellular organisms to complex multicellular entities. Among the fundamental factors driving the evolution of multicellular life, it is worth highlighting the emergence and diversification of gene families, such as homeobox transcription factors (TF), which are key in animal development and evolution. In our research on the evolutionary trajectory towards multicellularity, we focus on the analysis of some homeobox gene families using a good repository of complete genomes and transcriptomes at our disposal, and we conduct an exhaustive comparative genomic analysis using specialized bioinformatics tools, on a dataset that includes a broad taxon sampling of Holozoa, something that has not been done yet.
  • Descripció

    Treball de fi de grau en Bioinformàtica. Curs 2023-2024
    Tutora: Marta Alvarez-Presas
  • Mostra el registre complet