Development and validation of pharmacoinformatic similarity-based tools for safety assessment of chemicals
Mostra el registre complet Registre parcial de l'ítem
- dc.contributor.author Pinto Gil, Kevin
- dc.contributor.other Pastor Maeso, Manuel
- dc.contributor.other Universitat Pompeu Fabra. Departament de Ciències Experimentals i de la Salut
- dc.date.accessioned 2024-03-16T02:33:17Z
- dc.date.available 2024-03-16T02:33:17Z
- dc.date.issued 2020-02-17T16:51:03Z
- dc.date.issued 2020-02-17T16:51:03Z
- dc.date.issued 2020-01-31
- dc.date.modified 2024-03-15T10:57:31Z
- dc.description.abstract Despite the investment of vast amounts of money over the last decades, drug discovery and development remains an inefficient process, which can be stopped at different steps, leading to the loss of all resources invested. For this reason, there is an urgent need to develop methods for relating chemical structural information and in vitro bioactivity to toxicity outcomes in early drug development stages. This thesis describes novel in silico prediction methods, using novel similarity metrics and prediction tools adapted to the Chemical Safety Assessment (CSA) of drugs. Their use is illustrated by their application to liver toxicity endpoints. The proposed approach involves five steps: (1) Data collection, (2) best similarity metrics identification, (3) read across similarity validation, (4) QSAR modelling, and (5) implementation.
- dc.description.abstract A pesar de las inmensas cantidades de dinero invertidas en las últimas décadas, el descubrimiento y desarrollo de nuevos fármacos sigue siendo un proceso ineficiente, que puede detenerse en diferentes fases, implicando una pérdida importante de todos los recursos invertidos. Por esta razón, existe una necesidad muy urgente de desarrollar métodos que relacionen la información estructural química y la bioactividad in vitro con los resultados de toxicidad en las primeras etapas de desarrollo de fármacos. Esta tesis describe nuevos métodos de predicción in silico, utilizando nuevas métricas de semejanza y herramientas de predicción adaptadas a la Evaluación de Seguridad Química de medicamentos. Su uso se caracteriza por su aplicación en toxicidad hepática. El enfoque propuesto implica cinco pasos: (1) Recopilación de datos, (2) identificación de métricas de mejor semejanza, (3) validación de la semejanza usando Read across, (4) modelado QSAR e (5) implementación.
- dc.description.abstract Programa de doctorat en Biomedicina
- dc.format 151 p.
- dc.format application/pdf
- dc.format application/pdf
- dc.identifier http://hdl.handle.net/10803/668663
- dc.identifier.uri http://hdl.handle.net/10230/43647
- dc.language.iso eng
- dc.publisher Universitat Pompeu Fabra
- dc.rights ADVERTIMENT. Tots els drets reservats. L'accés als continguts d'aquesta tesi doctoral i la seva utilització ha de respectar els drets de la persona autora. Pot ser utilitzada per a consulta o estudi personal, així com en activitats o materials d'investigació i docència en els termes establerts a l'art. 32 del Text Refós de la Llei de Propietat Intel·lectual (RDL 1/1996). Per altres utilitzacions es requereix l'autorització prèvia i expressa de la persona autora. En qualsevol cas, en la utilització dels seus continguts caldrà indicar de forma clara el nom i cognoms de la persona autora i el títol de la tesi doctoral. No s'autoritza la seva reproducció o altres formes d'explotació efectuades amb finalitats de lucre ni la seva comunicació pública des d'un lloc aliè al servei TDX. Tampoc s'autoritza la presentació del seu contingut en una finestra o marc aliè a TDX (framing). Aquesta reserva de drets afecta tant als continguts de la tesi com als seus resums i índexs.
- dc.rights info:eu-repo/semantics/openAccess
- dc.source TDX (Tesis Doctorals en Xarxa)
- dc.subject.keyword Drug development
- dc.subject.keyword Safety assessment
- dc.subject.keyword Hepatotoxicity
- dc.subject.keyword Chemical similarity
- dc.subject.keyword Diseño de fármacos
- dc.subject.keyword Evaluación de la seguridad
- dc.subject.keyword Hepatotoxicidad
- dc.subject.keyword Semejanza química
- dc.subject.keyword Reproducibilidad
- dc.subject.keyword 615
- dc.title Development and validation of pharmacoinformatic similarity-based tools for safety assessment of chemicals
- dc.type info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
- dc.type info:eu-repo/semantics/publishedVersion