Engineering plastic-eating enzyme with mono(2-Hydroxyethyl) terephthalic acid substrate using protein energy landscape exploration

Mostra el registre complet Registre parcial de l'ítem

• dc.contributor.author Galiano Riosalido, Stefano
• dc.date.accessioned 2024-12-04T12:18:29Z
• dc.date.available 2024-12-04T12:18:29Z
• dc.date.issued 2024-06-18
• dc.description Treball de fi de grau en Bioinformàtica. Curs 2023-2024ca
• dc.description Tutors: Joan Gimenez Diaz, Víctor Guallar Tasíesca
• dc.description.abstract Aquesta investigació té com a objectiu millorar la degradació del plàstic mitjançant l'enginyeria de proteïnes de BL21 DE3 d'Escherichia coli per millorar l'activitat catalítica. Usa una tecnologia innovadora que és PELE, processos com la mutagènesi d'aminoàcids amb l'objectiu d'introduir una tríada catalítica similar a les MHETases. Finalment, els mutants prometedors es processen amb simulacions de dinàmica molecular per determinar l'estabilitat estructural i el potencial catalític. Culminant amb la validació a través d'un laboratori on proben els microorganismes dissenyats per veure si creixen amb el plàstic.ca
• dc.description.abstract Esta investigación tiene como objetivo mejorar la degradación del plástico mediante la ingeniería de proteínas de la cepa BL21 DE3 de Escherichia coli para mejorar la actividad catalitica. Usa una tecnología innovadora que es PELE, procesos como mutagénesis de aminoácidos con el objetivo de introducir una tríada catalítica similar a las MHETasas. Finalmente los mutantes prometedores se procesan con simulaciones de dinámica molecular para determinar la estabilidad estructural y el potencial catalítico. Culminando con la validación a través de un laboratorio donde prueban los microorganismos diseñados para ver si crecen con el plastico.es
• dc.description.abstract This research aims to enhance plastic degradation by engineering Escherichia coli strain BL21 DE3 proteins for improved MHET binding and catalytic activity. It uses a groundbreaking technology which is Protein energy landscape exploration (PELE), processes as amino acid mutagenesis with its target being to introduce a catalytic triad similar to MHETases. Only the promising mutants are later on processed with molecular dynamics simulations for structural stability and catalytic potential. It culminates with the validation through a wet lab in which they test the engineered microorganisms to see if they grow on plastic.en
• dc.format.mimetype application/pdf*
• dc.identifier.uri http://hdl.handle.net/10230/68917
• dc.language.iso engca
• dc.rights This is an Open Access article distributed under the terms of the Creative Commons Attribution-NonCommercial-NoDerivs 3.0 licenseca
• dc.rights.accessRights info:eu-repo/semantics/openAccessca
• dc.rights.uri http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/es/ca
• dc.subject.keyword Activa siteen
• dc.subject.keyword Catalytic triaden
• dc.subject.keyword Pluryzimeen
• dc.subject.other Treball de fi de grau – Curs 2023-2024ca
• dc.title Engineering plastic-eating enzyme with mono(2-Hydroxyethyl) terephthalic acid substrate using protein energy landscape explorationca
• dc.type info:eu-repo/semantics/bachelorThesisca