Engineering plastic-eating enzyme with mono(2-Hydroxyethyl) terephthalic acid substrate using protein energy landscape exploration

Abstract

Aquesta investigació té com a objectiu millorar la degradació del plàstic mitjançant l'enginyeria de proteïnes de BL21 DE3 d'Escherichia coli per millorar l'activitat catalítica. Usa una tecnologia innovadora que és PELE, processos com la mutagènesi d'aminoàcids amb l'objectiu d'introduir una tríada catalítica similar a les MHETases. Finalment, els mutants prometedors es processen amb simulacions de dinàmica molecular per determinar l'estabilitat estructural i el potencial catalític. Culminant amb la validació a través d'un laboratori on proben els microorganismes dissenyats per veure si creixen amb el plàstic.Esta investigación tiene como objetivo mejorar la degradación del plástico mediante la ingeniería de proteínas de la cepa BL21 DE3 de Escherichia coli para mejorar la actividad catalitica. Usa una tecnología innovadora que es PELE, procesos como mutagénesis de aminoácidos con el objetivo de introducir una tríada catalítica similar a las MHETasas. Finalmente los mutantes prometedores se procesan con simulaciones de dinámica molecular para determinar la estabilidad estructural y el potencial catalítico. Culminando con la validación a través de un laboratorio donde prueban los microorganismos diseñados para ver si crecen con el plastico.This research aims to enhance plastic degradation by engineering Escherichia coli strain BL21 DE3 proteins for improved MHET binding and catalytic activity. It uses a groundbreaking technology which is Protein energy landscape exploration (PELE), processes as amino acid mutagenesis with its target being to introduce a catalytic triad similar to MHETases. Only the promising mutants are later on processed with molecular dynamics simulations for structural stability and catalytic potential. It culminates with the validation through a wet lab in which they test the engineered microorganisms to see if they grow on plastic.