Predicting the template sequence used in CRISPR experiments
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- dc.contributor.author Escobosa Olmo, Marc
- dc.date.accessioned 2022-12-05T12:56:25Z
- dc.date.available 2022-12-05T12:56:25Z
- dc.date.issued 2022-06-15
- dc.description Treball de fi de grau en Bioinformàtica. Curs 2021-2022ca
- dc.description Tutor: Marc Güell Cargol i Mireia Olivellaca
- dc.description.abstract He participat en el desenvolupament de la eina CRISPR-A, el primer mètode basat en NGS per la avaluació de la edició genètica, i he creat tres models “Boscos aleatoris”, cadascun d’ells especialitzat en la predicció de les modificacions realitzades en els experiments CRISPR que son: delecions, insercions y substitucionsca
- dc.description.abstract Participé en el desarrollo de la herramienta CRISPR-A, el primer método basado en la NGS para la evaluación de la edición de genes, y creé tres modelos “Bosques Aleatorios”, cada uno de ellos especializado en la predicción de las modificaciones realizadas en los experimentos CRISPR que son: deleciones, inserciones y sustituciones sin disponer de la secuencia objetivo.
- dc.description.abstract I participated in developing the CRISPR-A tool, the first NGS-based method for gene-editing assessment, and created three Random Forest models each specialising in predicting the modification made in CRISPR experiments that are deletions, insertions or substitutions without having the template sequence available.en
- dc.format.mimetype application/pdf*
- dc.identifier.uri http://hdl.handle.net/10230/55086
- dc.language.iso engca
- dc.rights This is an Open Access article distributed under the terms of the Creative Commons Attribution-NonCommercial-NoDerivs 3.0 licenseca
- dc.rights.accessRights info:eu-repo/semantics/openAccessca
- dc.rights.uri http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/es/ca
- dc.subject.keyword Protoespaciador
- dc.subject.keyword Pipelineen
- dc.subject.keyword Seqüencia objectiuca
- dc.subject.keyword Reparació dirigida per homologiaca
- dc.subject.keyword Edició de qualitatca
- dc.subject.keyword Edició de baseca
- dc.subject.keyword Seqüenciació de nova generacióca
- dc.subject.keyword Secuencia objetivo
- dc.subject.keyword Reparación dirigida por homología
- dc.subject.keyword Edición de calidad
- dc.subject.keyword Edición de base
- dc.subject.keyword Bosques aleatorios
- dc.subject.keyword Secuenciación de nueva generación
- dc.subject.keyword Protospaceren
- dc.subject.keyword Template sequenceen
- dc.subject.keyword Homologous directed repairen
- dc.subject.keyword Prime editingen
- dc.subject.keyword Base editingen
- dc.subject.keyword Next-generation sequencingen
- dc.subject.other Treball de fi de grau – Curs 2021-2022ca
- dc.title Predicting the template sequence used in CRISPR experimentsca
- dc.type info:eu-repo/semantics/bachelorThesisca