Predicting the template sequence used in CRISPR experiments

Abstract

He participat en el desenvolupament de la eina CRISPR-A, el primer mètode basat en NGS per la avaluació de la edició genètica, i he creat tres models “Boscos aleatoris”, cadascun d’ells especialitzat en la predicció de les modificacions realitzades en els experiments CRISPR que son: delecions, insercions y substitucionsParticipé en el desarrollo de la herramienta CRISPR-A, el primer método basado en la NGS para la evaluación de la edición de genes, y creé tres modelos “Bosques Aleatorios”, cada uno de ellos especializado en la predicción de las modificaciones realizadas en los experimentos CRISPR que son: deleciones, inserciones y sustituciones sin disponer de la secuencia objetivo.I participated in developing the CRISPR-A tool, the first NGS-based method for gene-editing assessment, and created three Random Forest models each specialising in predicting the modification made in CRISPR experiments that are deletions, insertions or substitutions without having the template sequence available.