Welcome to the UPF Digital Repository
Recently added
JavaScript is disabled for your browser. Some features of this site may not work without it.
Bachelor's Degree in Bioinformatics (BDBI). Bachelor's Thesis: Recent submissions
Now showing items 1-20 of 26
-
(2022-06-21)La neurofibromatosi tipus 1 (NF1) és un trastorn genètic que predisposa les persones afectades al desenvolupament de tumors al sistema nerviós perifèric, com els neurofibromes plexiformes (pNF). Amb les tecnologies genòmiques ...
-
(2022-06-21)Hem desenvolupat "TCRanker", una eina computacional que pren com a entrada dades de seqüenciació d'ARN d'una sola cèl·lula (scRNA-seq) combinades amb dades de seqüenciació de TCR d'una sola cèl·lula (scTCR-seq) i classifica ...
-
(2022-06-21)El microambient tumoral té un rol clau en la iniciació i progressió del càncer d’ovari serós d’alt grau. Per aquesta raó, la seva caracterització podria incrementar el nostre coneixement de la malaltia i el desenvolupament ...
-
(2022-06-15)He participat en el desenvolupament de la eina CRISPR-A, el primer mètode basat en NGS per la avaluació de la edició genètica, i he creat tres models “Boscos aleatoris”, cadascun d’ells especialitzat en la predicció de les ...
-
(2022-06-21)Anàlisi del microbioma intestinal amb tècniques d’Intel·ligència Artificial per tal de descobrir biomarcadors de la malaltia de Parkinson a través de diferències entre el microbioma intestinal de subjectes controls i ...
-
(2022-06-21)Els problemes d'eficàcia i seguretat relacionats amb les qualitats d'absorció, distribució, metabolisme, excreció (ADME) i toxicitats diferents (T) són causes importants de falles en el desenvolupament de fàrmacs. Per ...
-
(2022-06-21)Quan es realitza la reconstrucció d'un arbre filogenètic, sovint veiem que l'ús d'un model incorrecte d'evolució pot produir un arbre mal modelat, i l'ús dels mètodes utilitzats comunament per fer-ho pot ser computacionalment ...
-
(2021)Els avenços en tecnologies de seqüenciació de nova generació han accelerat la detecció de mutacions somàtiques a les cèl·lules cancerígenes. Falta una eina de bioinformàtica per predir els neoantígens. L’objectiu d’aquesta ...
-
(2021)Les poblacions microbianes marines exerceixen un paper fonamental en l’ecologia dels mars. El potencial adaptatiu d’aquestes espècies és essencial per comprendre l’evolució de les seves poblacions a través de l’espai i el ...
-
(2021)Desenvolupament d'un algoritme basat en la similitud entre molècules i l'anàlisi de compostos per identificar molècules principals pel procés de desenvolupament de medicaments. El mètode està combinat amb simulacions de ...
-
(2021)We applied an enhancer prediction method to an extensive set of epigenetic profiles from the ENCODE project. We identified enhancer elements in 104 human primary cells, cell lines, and tissues. This extensive generation ...
-
(2021)In this project, a series of simulations are prepared using the Morris-Lecar model, and a set of mathematical theories and transformations are applied which lead to the result that a neuronal dynamical system’s electrical ...
-
(2021)En aquest projecte s’ha explorat l’aplicació d’una intel·ligència artificial al procés d’obtenció d’imatges d’OligoFISSEQ per tal de classificar-les segons la seva qualitat. S’han desenvolupat i provat diferents processos ...
-
(2021)Aquest projecte pretén millorar l'eficiència de la interpretació de variants NGS, ja que és un procés manual no escalable que requereix molt de temps. En primer lloc, s’ha millorat l'especificitat detectant les CNV, reduint ...
-
(2021)El procés d’anàlisi de la metilació de l'ADN requereix l'ús d'eines que impliquen habilitats de programació; per això, és necessari crear aplicacions que produeixin resultats d'una manera senzilla i interactiva que permeti ...
-
(2021-11-16)L’objectiu d’aquest projecte és trobar els límits de diversitat genètica d’un microbioma marí, per assolir l’objectiu utilitzarem un total de 50 metagenomes obtinguts del mateix microbioma. El tema principal s’estudiarà ...
-
(2021)Hem desenvolupat un seguit d’eines computacionals per veure com el cribratge virtual és dut a terme, habilitant una eficient exploració amb alta qualitat d’aquestes grans col·leccions químiques de compostos. Primer realitzem ...
-
(2021)El trastorn bipolar, abans anomenat depressió maníaca, és una condició de salut mental caracteritzada per canvis d’humor extrems que poden anar des de màxims extrems (mania) fins a mínims extrems (depressió). L’objectiu ...
-
(2020)Aquest projecte es centra en la necessitat de desenvolupar un mètode per definir la precisió d’un Alineament Múltiple de Seqüències mitjançant l’assignació d’un valor de precisió a cada una de les seqüències que constitueixen ...
-
(2020)En aquest estudi analitzem l'estat ancestral dels al·lels de risc de trastorns psiquiàtrics. L'assignació d'estat ancestral es basa en l'al·lel present en el ximpanzé. Les dades es van obtenir a partir de l’anàlisi GWAS. ...
Now showing items 1-20 of 26
