Genetic, genomic and epigenetic alterations in congenital malformations : implications in genetic counseling

Serra Juhé, Clara

Genetic, genomic and epigenetic alterations in congenital malformations : implications in genetic counseling

Document Type

Doctoral thesis
Published Version

Author

Serra Juhé, Clara

Director

Pérez Jurado, Luis Alberto

Publication Date

2012-10-20

Pages

206 p.

Citation

Serra Juhé, C. Genetic, genomic and epigenetic alterations in congenital malformations : implications in genetic counseling. Universitat Pompeu Fabra; 2012. handle: http://hdl.handle.net/10803/96194

This citation was generated automatically.

Doctoral program

Programa de doctorat en Biomedicina

Abstract

Mechanisms underlying congenital malformations are largely unknown despite its high incidence, affecting 2-3% of liveborn infants. A broader knowledge about the causes of birth defects would provide valuable information regarding the outcome and prognosis of the anomaly, the development and establishment of diagnostic protocols, the design of therapeutic strategies and genetic counseling to the family. Different approaches have been used in the present thesis regarding technologies and model diseases to elucidate the contribution of genetic and epigenetic alterations in the etiopathogenesis of congenital malformations. Copy number variations, methylation patterns, as well as point mutations have been explored. Moreover, a study to analyze genetic counseling in relation to one of the new molecular techniques used has been performed. Obtained data reveal a relevant role of genetic and epigenetic alterations in congenital malformations, in some cases as a unique cause to explain the disease and in others as part of an oligogenic or multifactorial model.
Els mecanismes causants de les malformacions congènites són poc coneguts malgrat l’elevada incidència d’aquestes patologies, que afecten el 2-3% de recent nascuts. Un coneixement més ampli de les causes de les anomalies congènites proporcionaria informació rellevant pel que fa al pronòstic de l’anomalia, el desenvolupament i establiment de protocols diagnòstics, el disseny d’estratègies terapèutiques, així com l’assessorament genètic a la família. En la tesi que es presenta s’han utilitzat diferents estratègies, pel que fa a tecnologies i models de malalties, amb l’objectiu d’esbrinar la contribució d’alteracions genètiques i epigenètiques en l’etiopatogènia de les malformacions congènites. S’han analitzat variacions en número de còpia, patrons de metilació, així com mutacions puntuals. D’altra banda, també s’ha realitzat un estudi per aprofundir en l’assessorament genètic en relació a una de les noves tècniques moleculars utilitzades. Els resultats obtinguts indiquen que les altercacions genètiques i epigenètiques tenen una contribució molt rellevant en l’etiologia de les malformacions congènites, en alguns casos com a causa única de la malaltia i en altres com a component d’un model oligogènic o multifactorial.

Keywords

Malformacions congènites, Malformacions cardíaques congènites, Epigenètica, Variacions en número de còpia (CNV), Mutacions puntuals, Assessorament genètic, Análisis cromosòmica en micromatrius, Seqüenciació d’exoma, Metilació del DNA, Congenital malformations, Congenital heart defects, Epigenetics, Copy number variation (CNV), Point mutations, Genetic counseling, Chromosomal microarray analysis, Exome sequencing, DNA methylation