Pathway oriented stroid hormone-dependent transcriptome analysis. Establishment of a custom cDNA microarray to study hormone signaling in breast cancer

Miñana Gómez, Belén

Pathway oriented stroid hormone-dependent transcriptome analysis. Establishment of a custom cDNA microarray to study hormone signaling in breast cancer

Document Type

Doctoral thesis
Published Version

Author

Miñana Gómez, Belén

Director

Sumoy Van Dyck, Lauro
Beato, Miguel

Publication Date

2008-03-06

Citation

Miñana Gómez, B. Pathway oriented stroid hormone-dependent transcriptome analysis. Establishment of a custom cDNA microarray to study hormone signaling in breast cancer. Universitat Pompeu Fabra; 2008. handle: http://hdl.handle.net/10803/7173

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Doctoral program

Programa de doctorat en Biomedicina

Abstract

Para avanzar en el entendimiento de las vías de señalización moleculares involucradas en la progresión de cáncer tumoral, se construyo una plataforma personalizada de cDNAs, la cual contiene genes de vías de señalización representativas para investigar la respuesta dinámica temporal a hormonas (progesterona y estradiol) empleando como modelo la línea celular T47D-MTVL e inhibidores específicos de las vías de señalización. Adicionalmente, se realizó un análisis de los perfiles de expresión de un grupo de tumores de mama encontrando buena correlación con los datos clínico-histopatológicos y mostrando como fenotipos específicos correlacionan con mal pronóstico. Los genes más significativos capaces de discriminar entre los fenotipos de tumor fueron determinados, y probados sobre un nuevo grupo de muestras, asignándolas a los subtipos predichos. El análisis de las vías de señalización de los genes más significativos de cada fenotipo fue realizado para elucidar las vías moleculares más representativas afectadas en cada clase de tumor.

Keywords

R5020, hormonas esteroideas, perfil de expresión génica, fenotipo luminar, fenotipo de tumores mamarios, fenotipo basal, cDNA microarrays, T47D, cáncer de mama, tumors hormona-dependents, R5020, progesterona, hormones esteroidees, perfil d'expressió gènica, fenotip de tumors mamaris, fenotip luminar, fenotip basal, cDNA microarrays, càncer de mama, tumores hormona-dependientes T47D, progesterona