Quantitative modelling of mouse limb morphogenesis

Böhm, Bernd R.

Quantitative modelling of mouse limb morphogenesis

Document Type

Doctoral thesis
Published Version

Author

Böhm, Bernd R.

Director

Sharpe, James

Publication Date

2011-05-18

Pages

126 p.

Citation

Böhm, B. Quantitative modelling of mouse limb morphogenesis. Universitat Pompeu Fabra; 2011. handle: http://hdl.handle.net/10803/31967

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Doctoral program

Programa de doctorat en Biomedicina

Abstract

In this thesis we combine quantitative measurements of mouse limb morphogenesis and computer modelling to test a well established theory about the cellular mechanisms promoting limb elongation. A distally directed gradient of cellular proliferation was believed to be the driving mechanism for limb outgrowth. We find that the empirically measured spatial proliferation pattern fails to promote normal development - a reverse engineering algorithm was applied and revealed a proliferation pattern that could indeed carry out normal development. The differences between those patterns is dramatic and suggests that isotopic cellular proliferation alone has very little impact on limb morphogenesis and other – non isotropic - mechanisms need to be involved.
En esta tesis tratamos de testar una bien establecida teor´ıa sobre los mecanismos celulares que promueven de la elongaci´on de las extremidades. Para eso combinamos mediciones cuantitativas del proceso morfogen ´etico de la extremidad del rat´on con modelos computacionales. Se cre´ıa que la fuerza conductora del crecimiento de las extremidades era un gradiente en sentido distal del incremento de la proliferaci´on celular. Descubrimos que el patr´on de proliferaci´on celular basado en medidas emp´ıricas no consegu´ıa promover un desarrollo normal, mientras que un algoritmo de ingenier´ıa inversa aplicado al proceso revel´o un patr´on que si podr´ıa. La diferencia entre estos dos patrones es inmensa y sugiere que la proliferaci´on celular isotropica por si sola tiene muy poco impacto sobre la morfog´enesis de las extremidades, indicando as´ı la necesidad de que otros procesos no isotr´opicos se hallen involucrados.

Keywords

Limb development, Systems Biology, modelling, parameter optimization, morphometrics, Deasarrollo de las extremidades, Biología de sistemas, construcción de modelos, optimización de parámetros morfometría, cuantificación