Identification of clinically relevant genetic variation in immune-mediated inflammatory diseases using genome-wide approaches

Aterido Ballonga, Adrià

Identification of clinically relevant genetic variation in immune-mediated inflammatory diseases using genome-wide approaches

Document Type

Doctoral thesis
Published Version

Author

Aterido Ballonga, Adrià

Director

Marsal Barril, Sara
Julià Cano, Antoni

Publication Date

2019-02-26

Pages

209 p.

Citation

Aterido Ballonga, A. Identification of clinically relevant genetic variation in immune-mediated inflammatory diseases using genome-wide approaches. Universitat Pompeu Fabra; 2019. handle: http://hdl.handle.net/10803/666363

This citation was generated automatically.

Doctoral program

Programa de doctorat en Biomedicina

Abstract

Rheumatoid arthritis, psoriasis, psoriatic arthritis, systemic lupus erythematosus, Crohn’s disease and ulcerative colitis are six of the most prevalent immune-mediated inflammatory diseases (IMIDs) and are associated with a high socio-economic impact. There is compelling evidence that IMIDs are genetically complex diseases. To date, however, the genetic component of IMIDs has been only partially explained. Identifying new clinically relevant variation is therefore of major clinical interest. The objective of the present thesis was to identify new genetic variation underlying IMIDs. The research activity here presented is the result of analyzing high-throughput genomic data from a large cohort of IMID patients collected by the IMID Consortium. Using genome-wide approaches and functional analyses, we have identified new genetic variants associated to IMID susceptibility, IMID clinical phenotypes and specific treatment outcomes. Taken together, these findings contribute to better understanding the genetic basis of IMIDs and suggest more specific and preventive therapeutic strategies.
L’artritis reumatoide, la psoriasis, l’artritis psoriàsica, el lupus eritematós sistèmic, la malaltia de Crohn i la colitis ulcerosa són sis malalties inflamatòries mediades per immunitat (IMIDs) d’elevada prevalença i amb un fort impacte socioeconòmic. Totes elles comparteixen un component genètic important. No obstant, a dia d’avui, només s’ha caracteritzat una part dels factors genètics de les IMIDs. La identificació de factors genètics clínicament rellevants presenta doncs un gran interès clínic per tal d’incorporar la informació genètica a la pràctica mèdica. L’objectiu d’aquesta tesi és identificar noves variants genètiques associades a les IMIDs. La recerca que es presenta és el resultat d’analitzar dades genòmiques d’una gran cohort de pacients amb IMIDs, els quals es van obtenir a través del consorci IMID Consortium. Mitjançant estratègies d’anàlisi de genoma complet i estudis funcionals, en aquesta tesi s’han identificat noves variants genètiques associades al risc de desenvolupar IMIDs així com als seus fenotips clínics i tractament. Aquesta tesi contribueix significativament a la caracterització del component genètic de les IMIDs i, des d’un punt de vista clínic, suggereix noves estratègies terapèutiques.

Keywords

Immune mediated inflammatory diseases (IMIDs), Genomics, Pharmacogenomics, Genome wide association study (GWAS), Malalties inflamatòries mediades per immunitat (IMIDs), Genòmica, Farmacogenòmica, Anàlisi d'associació de genoma complet (GWAS)