Variación haploide en secuencias nucleares humanas: el pseudogén GBA

Martínez Arias, Rosa

Variación haploide en secuencias nucleares humanas: el pseudogén GBA

Document Type

Doctoral thesis
Published Version

Author

Martínez Arias, Rosa

Director

Bertranpetit, Jaume

Publication Date

2001-03-12

Citation

Martínez Arias, R. Variación haploide en secuencias nucleares humanas: el pseudogén GBA. Universitat Pompeu Fabra; 2001. handle: http://hdl.handle.net/10803/7069

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Doctoral program

Programa de doctorat en Biomedicina

Abstract

Hemos analizado la variabilidad genética de una zona no codificante autosómica, el pseudogén homólogo al gen de la glucocerebrosidasa (psGBA). Parte del análisis se ha realizado desde la perspectiva de la genética de poblaciones humanas. Desde un punto de vista más genómico hemos establecido la dinámica de la región, a fin de entender las causas del espectro de variación. Hemos analizado el papel de la mutación, recombinación, conversión génica y, especialmente, selección. Por otra parte, psGBA es importante en la producción de alelos complejos GBA-psGBA, que provocan los tipos más severos de la enfermedad de Gaucher. Mostramos cómo el conocimiento de la variabilidad en psGBA ayuda al reconocimiento de estos alelos complejos. Finalmente, con los datos de variabilidad de dos regiones parálogas situadas en la misma región cromosómica (gen GBA / pseudogen psGBA) hemos comparado los patrones de mutación que presenta una misma secuencia bajo diferentes presiones selectivas.
We have analyzed the genetic variability in a non-coding autosomal region, the pseudogene homologous to the glucocerebrosidase gene (psGBA). Part of the analysis has been performed from the human populations point of view. From a more genomic perspective, we have established the region dynamics in order to understand the causes of the variability pattern. We have analyzed the role of mutation, recombination, gene conversion and, especially, selection. On the other hand, psGBA is important in the production of complex alleles GBA-psGBA, that lead to the most severe types of Gaucher disease. We show how the knowledge of psGBA variability helps to the identification of those complex alleles. Last, from the variability data from two paralogous regions located in the same chromosomal region (GBA gene /psGBA pseudogene) we have compared the mutation patterns shown by the same sequence under different selective pressures.

Keywords

selection, mutation pattern, autosomal haplotypes, hitchhiking, complex alleles, barrido selectivo, espectro de mutacion, seleccion, conversion genica, alelos complejos, gene conversion, peudogene, haplotipos autosomicos, Pseudogen