RNA is a molecule that is released by the different tissues into the
circulation. When it is found in the circulation it is called cell-free
RNA (cfRNA). This type of molecule has great potential as a
noninvasive biomarker as it can be found in plasma and can be
applied to multiple diseases.
Here we have shown that using cfRNA and circulating miRNAs with
RNA-seq and machine learning we can obtain diagnostic
signatures for two different diseases: pediatric cerebellar atrophy
and colorectal cancer. ...
RNA is a molecule that is released by the different tissues into the
circulation. When it is found in the circulation it is called cell-free
RNA (cfRNA). This type of molecule has great potential as a
noninvasive biomarker as it can be found in plasma and can be
applied to multiple diseases.
Here we have shown that using cfRNA and circulating miRNAs with
RNA-seq and machine learning we can obtain diagnostic
signatures for two different diseases: pediatric cerebellar atrophy
and colorectal cancer. Moreover, we have optimized the plasma
cfRNA processing protocol so it could be used for future biomarker
discovery studies.
This study has paved the way for future research using cfRNA, as
we have standardized and optimized all of the steps of the plasma
cfRNA processing pipeline as well as implemented multiple quality
control steps to ensure the optimal quality of the samples.
+
L'ARN és una molècula que s’allibera a la circulació per múltiples
teixits. Quan es troba a la circulació s'anomena ARN lliure de
cèl·lules (cfRNA). Aquest tipus de molècula té un gran potencial
com a biomarcador no invasiu, ja que es pot trobar al plasma i es
pot aplicar a múltiples malalties.
En aquest estudi hem demostrat que utilitzant cfRNA i miRNAs
circulants amb RNA-seq i aprenentatge automàtic podem obtenir
firmes diagnòstiques per a dues malalties diferents: atròfia
cerebel·losa pediàtrica ...
L'ARN és una molècula que s’allibera a la circulació per múltiples
teixits. Quan es troba a la circulació s'anomena ARN lliure de
cèl·lules (cfRNA). Aquest tipus de molècula té un gran potencial
com a biomarcador no invasiu, ja que es pot trobar al plasma i es
pot aplicar a múltiples malalties.
En aquest estudi hem demostrat que utilitzant cfRNA i miRNAs
circulants amb RNA-seq i aprenentatge automàtic podem obtenir
firmes diagnòstiques per a dues malalties diferents: atròfia
cerebel·losa pediàtrica i càncer colorectal. A més, hem optimitzat el
protocol de processament de cfRNA de plasma perquè es pugui
utilitzar per a futurs estudis de descobriment de biomarcadors.
Aquest estudi ha obert el camí per a futures investigacions amb
cfRNA, ja que hem estandarditzat i optimitzat tots els passos del
processament de cfRNA de plasma i hem implementat múltiples
passos de control de qualitat per garantir la òptima qualitat de les
mostres.
+
Programa de Doctorat en Biomedicina
