Welcome to the UPF Digital Repository

Understanding the molecular basis of neuronal 3'UTR length-dependent mRNA sorting

Show simple item record

dc.contributor.author Grawenhoff, Julia
dc.contributor.other Surrey, Thomas
dc.contributor.other Universitat Pompeu Fabra. Departament de Medicina i Ciències de la Vida
dc.date.accessioned 2024-03-16T02:33:56Z
dc.date.available 2024-03-16T02:33:56Z
dc.date.issued 2024-03-01T16:11:29Z
dc.date.issued 2024-01-24
dc.date.issued 2025-01-24T01:00:00Z
dc.identifier http://hdl.handle.net/10803/690222
dc.identifier.uri http://hdl.handle.net/10230/59309
dc.description.abstract The local translation of messenger RNAs (mRNAs) within different neuronal compartments is a prerequisite the formation of long-term memories. mRNAs are localized via active transport along microtubules, however, the components forming mRNA transport complexes are mostly unknown. A recently developed protein interaction screen suggested novel interactions between microtubule motor and RNA-binding proteins. In this thesis, we (1) expressed and purified the identified protein interactors, (2) developed a suitable fluorescence microscopy-based in vitro reconstitution approach, and (3) used it to study the proposed interactions. This enabled us to identify and a novel RNA transport complex that suggests a connection between the nuclear export and active transport of neuronal mRNAs along microtubules. Since one of the factors also functions as a 3’ untranslated region (3’UTR) length regulator, a recently identified determinant of mRNA localization, this thesis also establishes the groundwork for studying and understanding 3’UTR length-dependent mRNA sorting in neurons.
dc.description.abstract La traducció local d'ARN missatgers (ARNm) dins de diferents compartiments neuronals és un requisit previ per a la formació de memòria a llarg termini. Els ARNm es localitzen mitjançant el transport actiu al llarg dels microtúbuls, però els components que formen els complexos de transport d'ARNm són majoritàriament desconeguts. Un cribratge d'interacció de proteïnes desenvolupat recentment va suggerir noves interaccions entre els motors dels microtúbuls i les proteïnes d'unió a l'ARN. En aquesta tesi, (1) vam expressar i purificar les proteïnes que vam identificar com a interactors, (2) vam desenvolupar un enfocament adequat de reconstitució in vitro basat en microscòpia de fluorescència i (3) el vam utilitzar per estudiar les interaccions proposades. Això ens va permetre identificar un nou complex de transport d'ARN que suggereix una connexió entre l'exportació nuclear i el transport actiu d'ARNm neuronals al llarg dels microtúbuls. Com que un dels factors també funciona com a regulador de longitud de la regió no traduïda (3'UTR), un determinant recentment identificat de la localització de l'ARNm, aquesta tesi també estableix les bases per estudiar i entendre l'ordenació de l'ARNm depenent de la longitud de 3'UTR a les neurones.
dc.description.abstract Programa de Doctorat en Biomedicina
dc.format 150 p.
dc.format application/pdf
dc.language.iso eng
dc.publisher Universitat Pompeu Fabra
dc.rights L'accés als continguts d'aquesta tesi queda condicionat a l'acceptació de les condicions d'ús establertes per la següent llicència Creative Commons: http://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/
dc.rights http://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/
dc.rights info:eu-repo/semantics/embargoedAccess
dc.source TDX (Tesis Doctorals en Xarxa)
dc.title Understanding the molecular basis of neuronal 3'UTR length-dependent mRNA sorting
dc.type info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
dc.type info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.date.modified 2024-03-15T10:57:33Z
dc.subject.keyword mRNA transport
dc.subject.keyword mRNA localization
dc.subject.keyword Nuclear export
dc.subject.keyword 3’UTR length
dc.subject.keyword In vitro reconstitution
dc.subject.keyword Transport d'ARNm
dc.subject.keyword Localització de l'ARNm
dc.subject.keyword Exportació nuclear
dc.subject.keyword Longitud de 3’UTR
dc.subject.keyword Reconstitució in vitro
dc.subject.keyword 616.8


Files in this item

Files Size Format View

There are no files associated with this item.

This item appears in the following Collection(s)

Show simple item record

Search DSpace


Advanced Search

Browse

My Account

Statistics

In collaboration with Compliant to Partaking