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Strain detection and genetic diversity in Mediterranean marine microbial populations

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dc.contributor.author Rodríguez Llana, Sergio
dc.date.accessioned 2021-11-18T12:56:09Z
dc.date.available 2021-11-18T12:56:09Z
dc.date.issued 2021
dc.identifier.uri http://hdl.handle.net/10230/49017
dc.description Treball de fi de grau en Bioinformàtica. Curs 2020-2021
dc.description Tutor: Ramiro Logares Haurié
dc.description.abstract Les poblacions microbianes marines exerceixen un paper fonamental en l’ecologia dels mars. El potencial adaptatiu d’aquestes espècies és essencial per comprendre l’evolució de les seves poblacions a través de l’espai i el temps. Això comporta entendre i predir com podrien reaccionar a determinades condicions ambientals, incloent-hi la temperatura de l’aigua, i com la mida de la població podria canviar com a conseqüència. En aquest projecte, investiguem la formació de soques en alguns genomes de població abundants explorant la seva diversitat genètica, buscant variacions genètiques principalment presents en estacions d'aigua calenta i observant quines són les principals funcions proteiques que estan sent afectades.
dc.description.abstract Las poblaciones microbianas marinas desempeñan un papel fundamental en la ecología de los mares. El potencial adaptativo de estas especies es esencial para comprender la evolución de sus poblaciones a través del espacio y el tiempo. Esto conlleva entender y predecir cómo podrían reaccionar a ciertas condiciones ambientales, incluyendo la temperatura del agua, y cómo el tamaño de la población podría cambiar como consecuencia. En este proyecto, investigamos la formación de cepas en algunos genomas de población abundantes explorando su diversidad genética, buscando variaciones genéticas principalmente presentes en estaciones de agua caliente y observando cuáles son las principales funciones proteicas que están siendo afectadas.
dc.description.abstract Marine microbial populations play a key role in the ecology of the seas. The adaptive potential of these species is key to understanding the evolution of their populations across time and space. This means to comprehend and predict how they may react to certain environmental conditions, including water temperature, and how their population size may change as a consequence. In this project, we investigate the strain formation within some abundant population genomes exploring their genetic diversity, looking into genetic variations present mainly in hot water seasons, and observing which are the primary protein functions that are being affected.
dc.format.mimetype application/pdf
dc.language.iso eng
dc.rights This is an Open Access article distributed under the terms of the Creative Commons Attribution-NonCommercial-NoDerivs 3.0 license
dc.rights.uri http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/es/
dc.subject.other Treball de fi de grau – Curs 2020-2021
dc.title Strain detection and genetic diversity in Mediterranean marine microbial populations
dc.type info:eu-repo/semantics/bachelorThesis
dc.subject.keyword Soca
dc.subject.keyword Diversitat genètica
dc.subject.keyword Metagenòmica
dc.subject.keyword Poblacions microbianes marines
dc.subject.keyword Evolució
dc.subject.keyword Adaptació
dc.subject.keyword Factors ambientals
dc.subject.keyword Variacions genètiques
dc.subject.keyword SNPs
dc.subject.keyword Funció proteica
dc.subject.keyword Cepa
dc.subject.keyword Diversidad genética
dc.subject.keyword Metagenómica
dc.subject.keyword Poblaciones microbianas marinas
dc.subject.keyword Evolución
dc.subject.keyword Adaptación
dc.subject.keyword Factores ambientales
dc.subject.keyword Variaciones genéticas
dc.subject.keyword Función proteica
dc.subject.keyword Strain
dc.subject.keyword Genetic diversity
dc.subject.keyword Metagenomics
dc.subject.keyword Marine microbial populations
dc.subject.keyword Evolution
dc.subject.keyword Adaptation
dc.subject.keyword Environmental factors
dc.subject.keyword Genetic variations
dc.subject.keyword Protein function
dc.rights.accessRights info:eu-repo/semantics/openAccess

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