Neural microexons are the most conserved type of alternative splicing, suggesting a strong
functional relevance. Consistently, mutation of their master regulators leads to dramatic
neurodevelopmental alterations and autistic-like behaviors. However, the functional relevance of
individual microexons has only been elucidated for a few cases. Here, I aimed at investigating the
roles of individual microexons using zebrafish as a model system. We selected 18 microexons
conserved from fish to humans and ...
Neural microexons are the most conserved type of alternative splicing, suggesting a strong
functional relevance. Consistently, mutation of their master regulators leads to dramatic
neurodevelopmental alterations and autistic-like behaviors. However, the functional relevance of
individual microexons has only been elucidated for a few cases. Here, I aimed at investigating the
roles of individual microexons using zebrafish as a model system. We selected 18 microexons
conserved from fish to humans and generated deletion lines using CRISPR-Cas9. None of these
deletions produced gross phenotypic alterations or affected viability and fertility. However, a finer
characterization using different tests I have developed or adapted during my PhD revealed a wide
range of phenotypes at the cellular, tissular, behavioral and/or molecular level. Interestingly, in
many cases, these phenotypes were in opposite directions, a pattern that was mirrored at the
transcriptomic level. Altogether, our results depict a rich scenario for the functionality of
microexons.
+
Els microexons neurals són el tipus més conservat de “splicing” alternatiu, fet que indica una
gran rellevància funcional. A més a més, s’ha observat que mutacions produïdes en els seus
principals reguladors desencadenen conseqüències dràstiques en el neuro-desenvolupament i
també produeixen fenotips que s’aproximen a comportaments observats en l’autisme. Tot i així,
les funcions concretes dels microexons individuals han estat descrites en pocs casos. L’objectiu
principal d’aquest projecte és investigar ...
Els microexons neurals són el tipus més conservat de “splicing” alternatiu, fet que indica una
gran rellevància funcional. A més a més, s’ha observat que mutacions produïdes en els seus
principals reguladors desencadenen conseqüències dràstiques en el neuro-desenvolupament i
també produeixen fenotips que s’aproximen a comportaments observats en l’autisme. Tot i així,
les funcions concretes dels microexons individuals han estat descrites en pocs casos. L’objectiu
principal d’aquest projecte és investigar les funcions individuals dels microexons. Per dur-ho a
terme hem utilitzat el peix zebra com a model animal. Hem seleccionat 18 microexons,
conservats entre peixos i humans, i hem generat línies mutants de CRSPR-cas9 per deleccionarlos.
Cap de les línies generades mostra alteracions fenotípiques rellevants ni presenta alteracions
en la viabilitat o fertilitat dels individus. Tanmateix, mitjançant una caracterització acurada dels
fenotips i emprant diferents tests, que he desenvolupat i adaptat durant el transcurs del doctorat,
hem detectat tot un ventall de fenotips a nivell cel·lular, tissular, molecular i conductual.
Curiosament, en la majoria dels casos els fenotips van en direccions oposades, un patró que veiem
perfectament reflectit a nivell transcriptòmic. Els resultats en conjunt, ens mostren un escenari
molt ric per la funcionalitat dels microexons
+
Programa de doctorat en Biomedicina
