Welcome to the UPF Digital Repository

Temperature control for cell division : from microfluidics to AI

Show simple item record

dc.contributor.author Salaverria Izaguirre, Pablo G., 1993-
dc.contributor.other Vernos, Isabelle, 1959-
dc.contributor.other Cramer, Jeremy
dc.contributor.other Universitat Pompeu Fabra. Departament de Ciències Experimentals i de la Salut
dc.date.accessioned 2019-11-29T02:24:28Z
dc.date.available 2019-11-29T02:24:28Z
dc.date.issued 2019-11-22
dc.date.issued info:eu-repo/date/embargoEnd/2020-04-22
dc.identifier http://hdl.handle.net/10803/668014
dc.identifier.uri http://hdl.handle.net/10230/43031
dc.description.abstract This PhD thesis aimed to understand the impact of temperature at different levels (biology to physics) while performing live-cell imaging. A study and characterization of the role of the temperature during the cell division while using live-cell imaging on several biological models was done. Microfluidics was used to study it while accurately controlling the temperature on a microscope stage. Followed by characterizing a microscope setup to quantify the impact of different external factors on the sample temperature. Based on that, I built new microfluidic based devices able to control the sample temperature with high accuracy. Those devices were designed, manufactured and validated in collaboration with four research teams that used different biological models: S. Pombe, Hela-Kyoto cells, kidney cancer spheroids and in vitro microtubules. Finally, I developed an AI-based image classifier to study cell division, using data from samples thermalized by the accurate temperature control devices described above.
dc.description.abstract Esta tesis doctoral tuvo como objetivo comprender el impacto de la temperatura en diferentes niveles (biología o física) al realizar microscopia. Se estudio y se caracterizó la implicación de la temperatura aplicada la división celular de distintos modelos biológicos utilizando microscopia. Se utilizo la microfluidica para estudiarlo mientras se controlaba con precisión la temperatura en un microscopio. Se caracterizo un set de microscopia para cuantificar el impacto de diferentes factores externos en la temperatura de la muestra. Con ello, construí nuevos dispositivos microfluidicos capaces de controlar la temperatura de la muestra con precisión. Esos dispositivos fueron diseñados, fabricados y validados en colaboración con cuatro equipos de investigación que utilizaron diferentes modelos biológicos: S. Pombe, células Hela-Kyoto, esferoides de cáncer de riñón y microtúbulos in vitro. Finalmente, desarrolle un clasificador de imágenes usando inteligencia artificial para estudiar la división celular, utilizando imágenes adquiridas con el preciso control térmico descrito anteriormente.
dc.format application/pdf
dc.format 172 p.
dc.language.iso eng
dc.publisher Universitat Pompeu Fabra
dc.rights ADVERTIMENT. L'accés als continguts d'aquesta tesi doctoral i la seva utilització ha de respectar els drets de la persona autora. Pot ser utilitzada per a consulta o estudi personal, així com en activitats o materials d'investigació i docència en els termes establerts a l'art. 32 del Text Refós de la Llei de Propietat Intel·lectual (RDL 1/1996). Per altres utilitzacions es requereix l'autorització prèvia i expressa de la persona autora. En qualsevol cas, en la utilització dels seus continguts caldrà indicar de forma clara el nom i cognoms de la persona autora i el títol de la tesi doctoral. No s'autoritza la seva reproducció o altres formes d'explotació efectuades amb finalitats de lucre ni la seva comunicació pública des d'un lloc aliè al servei TDX. Tampoc s'autoritza la presentació del seu contingut en una finestra o marc aliè a TDX (framing). Aquesta reserva de drets afecta tant als continguts de la tesi com als seus resums i índexs.
dc.rights info:eu-repo/semantics/openAccess
dc.source TDX (Tesis Doctorals en Xarxa)
dc.title Temperature control for cell division : from microfluidics to AI
dc.type info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
dc.type info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.date.modified 2019-11-27T18:10:34Z
dc.subject.keyword Temperature control
dc.subject.keyword Live-cell imagine
dc.subject.keyword Microfluidics
dc.subject.keyword Cell division and Artificial Intelligence
dc.subject.keyword Control de temperatura
dc.subject.keyword Imagen células en vivo
dc.subject.keyword Microfluidica
dc.subject.keyword División celular e inteligencia artificial
dc.subject.keyword 575


Files in this item

Files Size Format View

There are no files associated with this item.

This item appears in the following Collection(s)

Show simple item record

Search DSpace


Advanced Search

Browse

My Account

Statistics

Compliant to Partaking