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Schlafen 12, a novel HIV restriction factor involved in latency

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dc.contributor.author Smutná, Katarína, 1991-
dc.contributor.other Meyerhans, Andreas
dc.contributor.other Díez Antón, Juana, 1962-
dc.contributor.other Universitat Pompeu Fabra. Departament de Ciències Experimentals i de la Salut
dc.date.accessioned 2020-02-19T02:25:15Z
dc.date.available 2020-02-19T02:25:15Z
dc.date.issued 2019-02-18
dc.identifier http://hdl.handle.net/10803/666297
dc.identifier.uri http://hdl.handle.net/10230/36867
dc.description.abstract The process of HIV latency establishment and maintenance is not clearly understood. Homeostatic proliferation (HSP) is a major mechanism by which long-lived naive and memory CD4 T cells are maintained in vivo. HSP also contributes to the persistence of HIV latent reservoir. Furthermore, HIV-infected naive CD4 T cells cultured under HSP condition are refractory to reactivation, in contrast to TCR-activated memory CD4 T cells. This might be due to the suggested post-transcriptional block in naive HSP-cultured cells. Here we compared a transcriptomic signature of naive and memory CD4 T cells. Among differentially expressed genes that may influence HIV latency, we identified Schlafen 12 (SLFN12) as an interesting candidate for a potential HIV restriction factor. Our results showed that SLFN12 establishes post-transcriptional block in HIV infected cells and thus inhibits both, HIV production as well as its reactivation from latently infected cells. These findings may help to better understand the mechanisms underlying HIV latency and its reversal in HSP-maintained naive CD4 T cells. All together it might contribute to the design of novel HIV eradication strategies.
dc.description.abstract El proceso por el cual el virus de la Inmunodeficiencia Humana (VIH) establece y mantiene un estado de latencia no se conoce en su totalidad. La proliferación homeostática (HSP, de sus siglas en ingés “Homeostatic proliferation”) es uno de los mecanismos por el cual las células T CD4 “naive” y de memoria se mantienen in vivo. Además, HSP también contribuye al mantenimiento del reservorio de virus en forma latente. Además, las células T CD4 “naive” infectadas y cultivadas en condiciones de HSP no son capaces de reactivarse a diferencia de las células T CD4 de memoria activadas vía TCR. Estudios previos sugieren que esta observación se debe a un bloqueo post-transcripcional en células T “naive” cultivadas en condiciones de HSP. En esta tesis comparamos la perfil del transcriptoma de células T CD4 “naive” y de memoria. Entre los genes diferencialmente expresados que podrían participar en el proceso de latencia del VIH, identificamos Schlafen 12 (SLFN12) como un candidato interesante que podría ser un factor de restricción del virus. Los resultados de este trabajo muestran que SLFN12 establece un bloqueo post-transcripcional en células infectadas por VIH, y de esta forma inhibe tanto la producción del virus como su reactivación en células infectadas de forma latente. Estas observaciones pueden ser de gran ayuda para entender mejor los mecanismos subyacentes a la latencia del VIH así como su reactivación en células CD4 T “naive” mantenidas bajo condiciones de HSP. En su conjunto, estos resultados podrían contribuir al diseño de nuevas estrategias para erradicar el VIH.
dc.format application/pdf
dc.format 116 p.
dc.language.iso eng
dc.publisher Universitat Pompeu Fabra
dc.rights ADVERTIMENT. L'accés als continguts d'aquesta tesi doctoral i la seva utilització ha de respectar els drets de la persona autora. Pot ser utilitzada per a consulta o estudi personal, així com en activitats o materials d'investigació i docència en els termes establerts a l'art. 32 del Text Refós de la Llei de Propietat Intel·lectual (RDL 1/1996). Per altres utilitzacions es requereix l'autorització prèvia i expressa de la persona autora. En qualsevol cas, en la utilització dels seus continguts caldrà indicar de forma clara el nom i cognoms de la persona autora i el títol de la tesi doctoral. No s'autoritza la seva reproducció o altres formes d'explotació efectuades amb finalitats de lucre ni la seva comunicació pública des d'un lloc aliè al servei TDX. Tampoc s'autoritza la presentació del seu contingut en una finestra o marc aliè a TDX (framing). Aquesta reserva de drets afecta tant als continguts de la tesi com als seus resums i índexs.
dc.rights info:eu-repo/semantics/openAccess
dc.source TDX (Tesis Doctorals en Xarxa)
dc.title Schlafen 12, a novel HIV restriction factor involved in latency
dc.type info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
dc.type info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.date.modified 2020-02-18T00:00:13Z
dc.subject.keyword HIV
dc.subject.keyword Schlafen12
dc.subject.keyword Homeostatic proliferation
dc.subject.keyword Post transcriptional block
dc.subject.keyword Latency
dc.subject.keyword Proliferación homeostática
dc.subject.keyword Inhibición post-transcripcional
dc.subject.keyword Latencia
dc.subject.keyword 578


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