Show simple item record

dc.contributor.author Martínez Corral, Rosa, 1991-
dc.contributor.other Garcia Ojalvo, Jordi
dc.contributor.other Universitat Pompeu Fabra. Departament de Ciències Experimentals i de la Salut
dc.date.accessioned 2019-01-20T02:22:33Z
dc.date.available 2019-01-20T02:22:33Z
dc.date.issued 2018-09-28
dc.date.issued info:eu-repo/date/embargoEnd/2020-02-28
dc.identifier http://hdl.handle.net/10803/664968
dc.identifier.uri http://hdl.handle.net/10230/36333
dc.description.abstract In this Thesis we have studied how dynamics and space modulate cellular behaviour, by means of mathematical modelling of particular biological examples. At the single cell level, we show how pulsatile input signals can be decoded by downstream targets with an appropriate circuit architecture and response timescales. Regarding pulse generation, we show that stochastic pulses of protein activity can arise from a perturbation amplified by negative feedback. Beyond a single cell, we propose that oscillations in bacterial communities emerge from glutamate limitation in the biofilm centre that is transmitted by potassium signalling throughout the community, and can be conceptualised in terms of a subcritical Hopf bifurcation. Moreover, pairs of biofilms synchronise their dynamics resulting into a nutrient timesharing strategy. Finally, we propose that the contact area of cell-cell interactions modifies cell fate outcomes in the context of Drosophila midgut homeostasis.
dc.description.abstract En aquesta Tesi hem estudiat com la dinàmica i l’espai modulen el comportament cel·lular, mitjançant models matemàtics de diversos exemples biològics. A nivell de cèl·lules individuals, mostrem que senyals polsàtils poden ser interpretats per les corresponents dianes intracel·lulars gràcies a circuits amb arquitectures i escales temporals de resposta adequades. Pel que fa a la generació de polsos, mostrem que polsos estocàstics poden produir-se a partir de l’amplificació d’una pertorbació mitjançant interaccions de retroalimentació negativa. Més enllà de cèl·lules individuals, proposem que oscil·lacions en comunitats bacterianes emergeixen de la limitació de glutamat al centre del biofilm, transmesa per senyalització per potassi a través de la comunitat, i que poden ser conceptualitzades en termes d’una bifurcació de Hopf subcrítica. A més a més, parelles de biofilms sincronitzen la seva dinàmica, donant lloc a un fenomen de compartició de recursos en el temps. Finalment, proposem que l’àrea de contacte entre cèl·lules modifica el destí cel·lular en el context de l’homeòstasi intestinal de Drosophila.
dc.format application/pdf
dc.format 229 p.
dc.language.iso eng
dc.publisher Universitat Pompeu Fabra
dc.rights L'accés als continguts d'aquesta tesi queda condicionat a l'acceptació de les condicions d'ús establertes per la següent llicència Creative Commons: http://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/
dc.rights info:eu-repo/semantics/embargoedAccess
dc.source TDX (Tesis Doctorals en Xarxa)
dc.title Modelling spatiotemporal cell regulation
dc.type info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
dc.type info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.date.modified 2019-01-18T17:11:59Z
dc.subject.keyword Signalling
dc.subject.keyword Stochastic pulsing
dc.subject.keyword Oscillations
dc.subject.keyword Bacillus subtilis
dc.subject.keyword Senyalització cel.lular
dc.subject.keyword Polsos estocàstics
dc.subject.keyword Oscil.lacions
dc.subject.keyword Bacillus subtilis
dc.subject.keyword Cèl.lules mare
dc.subject.keyword 576


Files in this item

Files Size Format View

There are no files associated with this item.

This item appears in the following Collection(s)

Show simple item record

Search DSpace


Advanced Search

Browse

My Account

Statistics

Compliant to Partaking