Fitness landscape is a concept, which describes the dependence of phenotype on
genotype. It was proposed almost a hundred years ago but only recent burst of
technologies finally allowed exploring it. We studied different aspects of fitness
landscape applying both: computational and experimental approaches. Using
mammalian mitochondrial tRNAs we proved that evolution can proceed not only along
the ridges of high fitness but also cross the low fitness valleys. Functional analysis of
more than 56 000 ...
Fitness landscape is a concept, which describes the dependence of phenotype on
genotype. It was proposed almost a hundred years ago but only recent burst of
technologies finally allowed exploring it. We studied different aspects of fitness
landscape applying both: computational and experimental approaches. Using
mammalian mitochondrial tRNAs we proved that evolution can proceed not only along
the ridges of high fitness but also cross the low fitness valleys. Functional analysis of
more than 56 000 mutants of green fluorescent protein from Aequorea victoria (avGFP)
allowed us to describe local fitness landscape around a particular fitness peak. In
addition to this we studied a case of population being on a slope – genetic code is
undergoing changes in Methanosarcina making them stay in sub-optimum.
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El paisaje adaptativo (fitness landscape) es un concepto que describe la dependencia del
fenotipo en el genotipo. Hace mas de cien años que éste concepto fue propuesto, pero es
sólo con la reciente expansión de tecnologías que finalmente ha podido ser explorado.
Hemos estudiado diferentes aspectos del paisaje adaptativo aplicando tanto
procedimientos computacionales como experimentales. Utilizando tRNAs
mitocondriales de mamíferos hemos comprobado que la evolución puede proceder no
sólo a lo largo ...
El paisaje adaptativo (fitness landscape) es un concepto que describe la dependencia del
fenotipo en el genotipo. Hace mas de cien años que éste concepto fue propuesto, pero es
sólo con la reciente expansión de tecnologías que finalmente ha podido ser explorado.
Hemos estudiado diferentes aspectos del paisaje adaptativo aplicando tanto
procedimientos computacionales como experimentales. Utilizando tRNAs
mitocondriales de mamíferos hemos comprobado que la evolución puede proceder no
sólo a lo largo de las crestas de elevado fitness sino también a través de los valles con
reducido fitness. Análisis funcional de mas de 56000 mutantes de la proteína verde
fuorescente de Aequorea Victoria (avGFP) nos permitió describir el paisaje adaptativo
local alrededor de un punto máximo específico de fitness. Mas aún, hemos estudiado un
caso de una población en una pendiente – el código genético está atravesando cambios
en Methanosarcina quedándose en sub-óptimo.
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Programa de doctorat en Biomedicina