Welcome to the UPF Digital Repository

Chemoisosterism and its impact on drug polypharmacology

Show simple item record

dc.contributor.author Jalencas i Giménez, Xavier, 1981-
dc.contributor.other Mestres i López, Jordi
dc.contributor.other Universitat Pompeu Fabra. Departament de Ciències Experimentals i de la Salut
dc.date.accessioned 2017-09-27T01:32:19Z
dc.date.available 2017-09-27T01:32:19Z
dc.date.issued 2013-09-17
dc.identifier B. 24230-2013
dc.identifier http://hdl.handle.net/10803/123574
dc.identifier.uri http://hdl.handle.net/10230/21145
dc.description.abstract In medicinal chemistry, two chemical fragments are considered bioisosteric if they bind to the same protein environment. Accordingly, looking at the same players from an opposite perspective, two protein environments can be considered chemoisosteric if they interact with the same chemical fragment. In this respect, this Thesis introduces the term chemoisosterism, which represents a new concept in drug discovery. Currently available crystal structures for protein-ligand complexes constitute a basis for the identification of chemoisosteric protein environments, of great utility for the construction of focused fragment chemical libraries. Under the premise that similar protein environments will probably bind to similar fragments, a novel approach to assess protein environment similarities is introduced and used to predict new chemoisosteric relationships. Examples of the potential applicability of chemoisosterism in fragment-based drug discovery are provided. The implications of chemoisosterism for drug polypharmacology are explored, leading to the speculation that the levels of polypharmacology observed in current drugs may just be a latent signature of the exploitation of chemoisosterism during evolution.
dc.description.abstract En química mèdica, dos fragments moleculars són considerats bioisostèrics si s’uneixen al mateix entorn de proteïna. Canviant la perspectiva sobre el mateix esdeveniment, dos entorns de proteïna poden ésser considerats quimioisostèrics si interaccionen amb el mateix fragment molecular. Aquesta Tesi introdueix el terme quimioisosterisme, un nou concepte en química farmacèutica. Les estructures actualment disponibles de complexos de proteïna i lligand constitueixen una font d’entorns de proteïna quimioisostèrics potencialment útils per a la construcció de llibreries de fragments moleculars dirigides a una proteïna diana en particular. Partint de la premissa que entorns de proteïna similars molt probablement interaccionaran amb fragments moleculars similars, aquesta Tesi presenta un nou mètode per a identificar entorns de proteïna similars, utilitzat per predir noves relacions quimioisostèriques. S’aporten també alguns exemples de potencials aplicacions del quimioisosterisme en la disciplina del descobriment de fàrmacs. Un anàlisis de les implicacions que té el quimioisosterisme en la polifarmacologia ens duu a la hipòtesis de que els nivells de polifarmacologia observats en la majoria de fàrmacs no són res més que una signatura de l’explotació del quimioisosterisme al llarg de l’evolució.
dc.format application/pdf
dc.format 194 p.
dc.language.iso eng
dc.publisher Universitat Pompeu Fabra
dc.rights L'accés als continguts d'aquesta tesi queda condicionat a l'acceptació de les condicions d'ús establertes per la següent llicència Creative Commons: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/3.0/es/
dc.rights info:eu-repo/semantics/openAccess
dc.source TDX (Tesis Doctorals en Xarxa)
dc.title Chemoisosterism and its impact on drug polypharmacology
dc.type info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
dc.type info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.date.modified 2017-09-24T10:43:55Z
dc.subject.keyword Chemoisosterism
dc.subject.keyword Drug discovery
dc.subject.keyword Medicinal Chemistry
dc.subject.keyword Binding site similarity
dc.subject.keyword Protein-ligand networks
dc.subject.keyword Chemical fragments
dc.subject.keyword Protein environments
dc.subject.keyword Quimioisosterisme
dc.subject.keyword Disseny de fàrmacs
dc.subject.keyword Química mèdica
dc.subject.keyword Similitud entre llocs d'unió
dc.subject.keyword Xarxes de proteïnes i lligands
dc.subject.keyword Fragments moleculars
dc.subject.keyword Entorns de proteïna
dc.subject.keyword 615


Files in this item

Files Size Format View

There are no files associated with this item.

This item appears in the following Collection(s)

Show simple item record

Search DSpace


Advanced Search

Browse

My Account

Statistics

Compliant to Partaking