Functional analysis of Drosophila melanogaster linker histone dH1

Welcome to the UPF Digital Repository

Vujatovic, Olivera, 1981-. Functional analysis of Drosophila melanogaster linker histone dH1. 2012
http://hdl.handle.net/10230/19798
dc.contributor.author Vujatovic, Olivera, 1981-
dc.contributor.other Azorín, F.
dc.contributor.other Universitat Pompeu Fabra. Departament de Ciències Experimentals i de la Salut
dc.date.accessioned 2013-07-12T01:50:00Z
dc.date.available 2013-07-12T01:50:00Z
dc.date.issued 2012-07-27
dc.identifier.uri http://hdl.handle.net/10230/19798
dc.description.abstract We did functional characterisation of Drosophila melanogaster linker histone, dH1. In the mutant state for this protein, we observed structural changes in polytene chromosomes chromocenter and nucleoli of mutant larvae. In addition, we performed a microarray analysis in H1 mutant background in order to determine contribution of dH1 to gene expression regulation. We determined effects of dH1 loss in different types of chromatin and we identified groups of differentially expressed (DE) genes, groups in sense of physical clusters of genes and genomic elements rather than groups of functionally related genes. We found that dH1 affects in greater extent expression of heterochromatin genes compared to its effect on euchromatin genes; that dH1 regulates transcription in a regional manner, since the genes physically nearest to the most DE genes tend to be upregulated as well; and that dH1 is negatively regulating expression of transposable elements and members of certain gene families. In addition, we found that dH1 is necessary for preserving genome stability. Among DE transposable elements we detected R1 and R2 retrotransposons, elements that are integrating specifically in rRNA locus. We showed that activation of their transcription is also upregulating expression of aberrant, transposon-inserted, rDNA units of the locus. In this regard we observed an accumulation of extra-chromosomal rDNA circles, increased γ-H2Av content, stop in cell proliferation and activation of apoptosis. Altogether, these results are revealing so far unknown role of histone H1 in preserving genome stability and its effects on cell proliferation.
dc.format.mimetype 142 p.
dc.format.mimetype application/pdf
dc.language.iso eng
dc.publisher Universitat Pompeu Fabra
dc.rights info:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights ADVERTIMENT. L'accés als continguts d'aquesta tesi doctoral i la seva utilització ha de respectar els drets de la persona autora. Pot ser utilitzada per a consulta o estudi personal, així com en activitats o materials d'investigació i docència en els termes establerts a l'art. 32 del Text Refós de la Llei de Propietat Intel·lectual (RDL 1/1996). Per altres utilitzacions es requereix l'autorització prèvia i expressa de la persona autora. En qualsevol cas, en la utilització dels seus continguts caldrà indicar de forma clara el nom i cognoms de la persona autora i el títol de la tesi doctoral. No s'autoritza la seva reproducció o altres formes d'explotació efectuades amb finalitats de lucre ni la seva comunicació pública des d'un lloc aliè al servei TDX. Tampoc s'autoritza la presentació del seu contingut en una finestra o marc aliè a TDX (framing). Aquesta reserva de drets afecta tant als continguts de la tesi com als seus resums i índexs.
dc.title Functional analysis of Drosophila melanogaster linker histone dH1
dc.date.modified 2013-07-10T11:35:38Z
dc.subject.keyword Histona H1
dc.subject.keyword Drosophila melanogaster
dc.subject.keyword Regulación de la expressión genética
dc.subject.keyword Elementos transponibles
dc.subject.keyword Estabilidad Genómica
dc.subject.keyword Modificaciones postranslacionales
dc.subject.keyword Linker histone
dc.subject.keyword Gene expression regulation
dc.subject.keyword Transposable elements
dc.subject.keyword Genome stability
dc.subject.keyword Posttranslational modifications
dc.subject.keyword 575

See full text
http://hdl.handle.net/10803/91286

Search


Advanced Search

Browse

My Account

Statistics