Genetic Analysis of the prehistoic peopling of Western Europe: Ancient DNA the role of contamination

Welcome to the UPF Digital Repository

Sampietro Bergua, Mª Lourdes. Genetic Analysis of the prehistoic peopling of Western Europe: Ancient DNA the role of contamination. 2007
http://hdl.handle.net/10230/16342
dc.contributor.author Sampietro Bergua, Mª Lourdes
dc.contributor.other Lalueza Fox, Carles
dc.contributor.other Bertranpetit, Jaume, 1952-
dc.contributor.other Universitat Pompeu Fabra. Departament de Ciències Experimentals i de la Salut
dc.date.accessioned 2013-07-12T01:49:41Z
dc.date.available 2013-07-12T01:49:41Z
dc.date.issued 2007-01-19
dc.identifier.uri http://hdl.handle.net/10230/16342
dc.description.abstract In this thesis we have addressed three different although related topics. First, we studied the post-mortem mutation damage rate of contaminated DNA sequences in ancient human remains focusing on the development of strategies to avoid pre-laboratory derived contaminations. We proposed a guideline to control them consisting in typing every single person involved on the manipulation of the remains, especially when they have not been excavated and washed under controlled conditions. Second, we successfully develop a non-invasive technique to sequence ancient remains but preserving it from the destruction. And third, we sequenced ancient human remains from different evolutionary times (from Paleolithic to post-Neolithic) to make inferences about the peopling of Western Europe focusing mainly in the Iberia peninsula. We found that there is a long term genetic continuity at least since the Neolithic. The only clear genetic discontinuity found is that involving two different human species, H. sapiens and H. neanderthalensis.
dc.description.abstract En la presente tesis hemos tratado tres temas diferentes aunque muy relacionados. Primero, hemos estudiado la tasa de mutación post-mortem de secuencias de ADN contaminante en restos humanos antiguos centrándonos en el desarrollo de estrategias para evitar que las muestras se contaminen antes de llegar al laboratorio. Proponemos una guía que consiste en el tipado genético de cada persona implicada en la manipulación de los restos, especialmente cuando estos han sido excavados y lavados bajo condiciones no controladas. Segundo, hemos desarrollado una técnica no invasiva para secuenciar DNA de restos humanos antiguos pero sin destruirlos. Y por ultimo, hemos secuenciado restos humanos antiguos pertenecientes a diferentes periodos evolutivos (desde el Paleolitico hasta el post-Neolitico) que nos han permitido hacer inferencias sobre el poblamiento Europeo centrándonos básicamente en la Península Ibérica. Hemos encontrado que ha habido una continuidad genética desde el Neolítico. La única clara discontinuidad genética encontrada es entre dos especies distintas: H. Sapiens y H.neanderthalensis.
dc.format.mimetype 198 p.
dc.format.mimetype application/pdf
dc.language.iso eng
dc.publisher Universitat Pompeu Fabra
dc.rights info:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights ADVERTIMENT. L'accés als continguts d'aquesta tesi doctoral i la seva utilització ha de respectar els drets de la persona autora. Pot ser utilitzada per a consulta o estudi personal, així com en activitats o materials d'investigació i docència en els termes establerts a l'art. 32 del Text Refós de la Llei de Propietat Intel·lectual (RDL 1/1996). Per altres utilitzacions es requereix l'autorització prèvia i expressa de la persona autora. En qualsevol cas, en la utilització dels seus continguts caldrà indicar de forma clara el nom i cognoms de la persona autora i el títol de la tesi doctoral. No s'autoritza la seva reproducció o altres formes d'explotació efectuades amb finalitats de lucre ni la seva comunicació pública des d'un lloc aliè al servei TDX. Tampoc s'autoritza la presentació del seu contingut en una finestra o marc aliè a TDX (framing). Aquesta reserva de drets afecta tant als continguts de la tesi com als seus resums i índexs.
dc.title Genetic Analysis of the prehistoic peopling of Western Europe: Ancient DNA the role of contamination
dc.date.modified 2013-07-10T11:35:41Z
dc.subject.keyword ADN antiguo
dc.subject.keyword ADN mitocondrial
dc.subject.keyword daño post-mortem
dc.subject.keyword contaminación
dc.subject.keyword diversidad genética humana
dc.subject.keyword diente
dc.subject.keyword suelo
dc.subject.keyword Neandertals
dc.subject.keyword Neolíticos
dc.subject.keyword Iberos
dc.subject.keyword ancient DNA
dc.subject.keyword mtDNA
dc.subject.keyword post-mortem DNA damage
dc.subject.keyword contamination
dc.subject.keyword teeth
dc.subject.keyword soil
dc.subject.keyword Neandertals
dc.subject.keyword Human genetic diversity
dc.subject.keyword Neolithic
dc.subject.keyword Iberians
dc.subject.keyword 575

See full text
http://hdl.handle.net/10803/79128

Search


Advanced Search

Browse

My Account

Statistics