Mechanism of regulation of the RPL30 pre-mRNA splicing in yeast

Welcome to the UPF Digital Repository

Macías Ribela, Sara. Mechanism of regulation of the RPL30 pre-mRNA splicing in yeast. 2008
http://hdl.handle.net/10230/12289
dc.contributor.author Macías Ribela, Sara
dc.contributor.other Vilardell, Josep
dc.contributor.other Universitat Pompeu Fabra. Departament de Ciències Experimentals i de la Salut
dc.date.accessioned 2013-07-12T01:51:30Z
dc.date.available 2013-07-12T01:51:30Z
dc.date.issued 2008-06-13
dc.identifier.uri http://hdl.handle.net/10230/12289
dc.description.abstract The mechanisms of pre-mRNA splicing regulation are poorly understood. Here we dissect how the Saccharomyces cerevisiae ribosomal L30 protein blocks splicing of its pre-mRNA upon binding a kink-turn structure including the 5' splice site. We show that L30 binds the nascent RPL30 transcript without preventing recognition of the 5' splice site by U1 snRNP but blocking U2 snRNP association with the branch site. Interaction of the factors BBP and Mud2p with the intron, relevant for U2 snRNP recruitment, is not affected by L30. Furthermore, the functions of neither the DEAD-box protein Sub2p in the incipient spliceosome, nor of the U2 snRNP factor Cus2p on branch site recognition, are required for L30 inhibition. These findings contrast with the effects caused by binding a heterologous protein to the same region, completely blocking intron recognition. Collectively, our data suggest that L30 represses a spliceosomal rearrangement required for U2 snRNP association with the nascent RPL30 transcript.
dc.format.mimetype application/pdf
dc.language.iso eng
dc.publisher Universitat Pompeu Fabra
dc.rights ADVERTIMENT. L'accés als continguts d'aquesta tesi doctoral i la seva utilització ha de respectar els drets de la persona autora. Pot ser utilitzada per a consulta o estudi personal, així com en activitats o materials d'investigació i docència en els termes establerts a l'art. 32 del Text Refós de la Llei de Propietat Intel·lectual (RDL 1/1996). Per altres utilitzacions es requereix l'autorització prèvia i expressa de la persona autora. En qualsevol cas, en la utilització dels seus continguts caldrà indicar de forma clara el nom i cognoms de la persona autora i el títol de la tesi doctoral. No s'autoritza la seva reproducció o altres formes d'explotació efectuades amb finalitats de lucre ni la seva comunicació pública des d'un lloc aliè al servei TDX. Tampoc s'autoritza la presentació del seu contingut en una finestra o marc aliè a TDX (framing). Aquesta reserva de drets afecta tant als continguts de la tesi com als seus resums i índexs.
dc.rights info:eu-repo/semantics/openAccess
dc.title Mechanism of regulation of the RPL30 pre-mRNA splicing in yeast
dc.date.modified 2013-07-10T11:29:02Z
dc.subject.keyword poylpyrimidine tract (Ppy tract)
dc.subject.keyword branch site (BS)
dc.subject.keyword ' splice site (3'ss)
dc.subject.keyword 5' splice site (5'ss)
dc.subject.keyword intron
dc.subject.keyword L30
dc.subject.keyword RPL30
dc.subject.keyword U2 snRNP
dc.subject.keyword U1 snRNP
dc.subject.keyword transcription
dc.subject.keyword regulation of splicing
dc.subject.keyword spliceosome assembly
dc.subject.keyword splicing
dc.subject.keyword gene expression
dc.subject.keyword 57

See full text
http://hdl.handle.net/10803/7112

Search


Advanced Search

Browse

My Account

Statistics