Analysis of genetic variation in microrna-mediated regulation and the susceptibility to anxiety disorders

Welcome to the UPF Digital Repository

Muiños Gimeno, Margarita. Analysis of genetic variation in microrna-mediated regulation and the susceptibility to anxiety disorders. 2009
http://hdl.handle.net/10230/11840
dc.contributor.author Muiños Gimeno, Margarita
dc.contributor.other Espinosa Parrilla, Yolanda
dc.contributor.other Universitat Pompeu Fabra. Departament de Ciències Experimentals i de la Salut
dc.date.accessioned 2013-07-12T01:49:52Z
dc.date.available 2013-07-12T01:49:52Z
dc.date.issued 2009-12-18
dc.identifier.uri http://hdl.handle.net/10230/11840
dc.description.abstract We have investigated genetic variation in microRNA-mediated regulation as a susceptibility factor for anxiety disorders following two different approaches. We first studied two isoforms of the candidate gene NTRK3 by re-sequencing its different 3'UTRs in patients with Panic (PD) and Obsessive Compulsive disorders (OCD) as well as controls. Two rare variants that altered microRNA-mediated regulation were identified in PD. Conversely, association of a common SNP with OCD hoarding subtype was found. Moreover, we have also studied a possible involvement of microRNAs in anxiety disorders. Consequently, we have analysed the genomic organisation and genetic variation of miRNA-containing regions to construct a panel of SNPs for association analysis. Case-control studies revealed several associations. However, it is worth remarking the associations of miR-22 and miR-488 with PD; two microRNAs for which functional assays and transcriptome analysis after microRNA overexpression showed significant repression of a subset of genes involved in physiological pathways linked to PD development.
dc.description.abstract Hem investigat la variació genètica a la regulació mediada per microRNAs com a factors de susceptibilitat pels trastorns d'ansietat seguint dues aproximacions diferents. Primer vam estudiar dues isoformes del gen candidat NTRK3 mitjançant la reseqüenciació dels seus diferents 3'UTRs a pacients de pànic (TP), a pacients amb trastorn obsessiu compulsiu (TOC) i a controls. Dues variants rares que alteren la regulació mediada per microRNAs foren identificades per TP. D'altra banda, es trobà associació d'un SNP comú amb el subtipus acumulador de TOC. A més, també hem estudiat la possible implicació dels microRNAs als trastorns d'ansietat. Conseqüentment, hem analitzat l'organització genòmica i la variació genètica a regions que contenen microRNAs per construir un panell d'SNPs per fer anàlisis d'associació. Els estudis cas-control van revelar algunes associacions. Tanmateix, val la pena destacar les associacions del miR-22 i el miR-488 amb TP; dos microRNAs pels quals assajos funcionals i anàlisis de transcriptoma després de la seva sobreexpressió han mostrat una repressió significativa d'un grup de gens implicats en vies fisiològiques lligades al desenvolupament del TP.
dc.format.mimetype application/pdf
dc.language.iso eng
dc.publisher Universitat Pompeu Fabra
dc.rights ADVERTIMENT. L'accés als continguts d'aquesta tesi doctoral i la seva utilització ha de respectar els drets de la persona autora. Pot ser utilitzada per a consulta o estudi personal, així com en activitats o materials d'investigació i docència en els termes establerts a l'art. 32 del Text Refós de la Llei de Propietat Intel·lectual (RDL 1/1996). Per altres utilitzacions es requereix l'autorització prèvia i expressa de la persona autora. En qualsevol cas, en la utilització dels seus continguts caldrà indicar de forma clara el nom i cognoms de la persona autora i el títol de la tesi doctoral. No s'autoritza la seva reproducció o altres formes d'explotació efectuades amb finalitats de lucre ni la seva comunicació pública des d'un lloc aliè al servei TDX. Tampoc s'autoritza la presentació del seu contingut en una finestra o marc aliè a TDX (framing). Aquesta reserva de drets afecta tant als continguts de la tesi com als seus resums i índexs.
dc.rights info:eu-repo/semantics/openAccess
dc.title Analysis of genetic variation in microrna-mediated regulation and the susceptibility to anxiety disorders
dc.date.modified 2013-07-10T11:29:06Z
dc.subject.keyword isoforma
dc.subject.keyword anàlisi de transcriptoma
dc.subject.keyword PCR
dc.subject.keyword assaig de luciferasa
dc.subject.keyword variant comuna
dc.subject.keyword variant rara
dc.subject.keyword reseqüenciar
dc.subject.keyword estudis d'associació
dc.subject.keyword poly-miRTS
dc.subject.keyword trastorn obsessiu-compulsiu
dc.subject.keyword trastorn de pànic
dc.subject.keyword trastorn d'ansietat
dc.subject.keyword variació genètica intraespecífica
dc.subject.keyword SNP
dc.subject.keyword NTRK3
dc.subject.keyword gen candidat
dc.subject.keyword element regulador
dc.subject.keyword microRNA
dc.subject.keyword variació genòmica
dc.subject.keyword desordres poligènics
dc.subject.keyword trets complexes
dc.subject.keyword isoform
dc.subject.keyword transcriptome analysis
dc.subject.keyword PCR
dc.subject.keyword luciferase assay
dc.subject.keyword common variant
dc.subject.keyword rare variant
dc.subject.keyword re-sequencing
dc.subject.keyword association studies
dc.subject.keyword poly-miRTS
dc.subject.keyword obsessive-compulsive disorder
dc.subject.keyword panic disorder
dc.subject.keyword anxiety disorder
dc.subject.keyword genetic variation within species
dc.subject.keyword SNP
dc.subject.keyword NTRK3
dc.subject.keyword candidate gene
dc.subject.keyword regulatory element
dc.subject.keyword microRNA
dc.subject.keyword genome variation
dc.subject.keyword polygenic disorders
dc.subject.keyword complex traits
dc.subject.keyword 57

See full text
http://hdl.handle.net/10803/7192

Search


Advanced Search

Browse

My Account

Statistics