Role of linker Histone H1 variants in cell proliferation, Chromatin Structure and Gene expression in breast cancer cells

Welcome to the UPF Digital Repository

Sancho Medina, Mònica. Role of linker Histone H1 variants in cell proliferation, Chromatin Structure and Gene expression in breast cancer cells. 2008
http://hdl.handle.net/10230/11824
dc.contributor.author Sancho Medina, Mònica
dc.contributor.other Jordan Vallès, Albert
dc.contributor.other Beato, Miguel
dc.contributor.other Universitat Pompeu Fabra. Departament de Ciències Experimentals i de la Salut
dc.date.accessioned 2013-07-12T01:49:49Z
dc.date.available 2013-07-12T01:49:49Z
dc.date.issued 2008-05-30
dc.identifier.uri http://hdl.handle.net/10230/11824
dc.description.abstract At least eleven histone H1 variants exist in mammalian somatic cells that bind to the linker DNA and stabilize the nucleosome particle contributing to higher order chromatin compaction. In addition of playing a structural role, H1 seems to be involved in the activation and repression of gene expression. It is not well known whether the different variants have specific roles or regulate specific promoters. We have explored this by inducible shRNA-mediated knock-down of each of the H1 variants in a human breast cancer cell line. Rapid inhibition of each H1 variant was not compensated by changes of expression of other variants. A different, reduced subset of genes is altered in each H1 knock-down. Interestingly, H1.2 depletion represses expression of a number of cell cycle genes. This is concomitant with a G1 arrest phenotype observed in this cell line. In addition, H1.2 depletion caused decreased global nucleosome spacing. These effects are specific of H1.2 depletion as they are not complemented by overexpression of other variants and they do not occur in knock-downs for the other variants. Moreover, H1.4 depletion caused cell death in T47D, being the first report of the essentiality of an H1 variant for survival in a human cell type. In addition to this, we have also investigated specificities of H1 subtypes location in particular promoters of interest in our laboratory, as well as specific interactions with other factors by generating HA-tagged H1 variant expressing cell lines.
dc.description.abstract Al menos once variantes de la histona H1 han sido identificadas en mamíferos, todas ellas se unen al ADN entre nucleosomas contribuyendo así, a la estabilización de la partícula nucleosómica y a la compactación de la cromatina en estructuras de alto orden. Además de jugar un papel estructural, H1 parece estar implicada en la activación y represión de la expresión génica. Se desconoce si las diferentes variantes de H1 tienen funciones específicas o regulan promotores específicos. Con el objetivo de investigar esta hipótesis se han generado líneas celulares que inhiben de forma inducible, mediante la tecnología de ARN interferente, la expresión de cada una de las variantes de forma específica. La inhibición de cada una de las variantes no es compensada por cambios en la expresión del resto de subtipos. Distintos grupos de genes resultan alterados con la depleción de cada una de las variantes de H1. La inhibición de H1.2 reprime la expresión de una serie de genes de ciclo celular, correlacionando con un fenotipo de arresto celular en fase G1 observado en esta línea. Además, la inhibición de H1.2 causa una disminución global del espaciamiento entre nucleosomas. Todos estos efectos parecen ser específicos para la falta de H1.2 ya que no son complementados por la sobreexpresión de otras variantes. Por otro lado, la inhibición de H1.4 causa muerte celular en T47D. Ésta es la primera vez que se describe que una variante de H1 es esencial para la supervivencia de una línea celular humana.En un segundo plano, se han construido líneas celulares con expresión de las variantes de H1 fusionadas al péptido HA, con el objetivo de estudiar la especificidad de su localización en promotores de interés para el grupo, así como interacciones específicas con otros factores celulares.
dc.format.mimetype application/pdf
dc.language.iso eng
dc.publisher Universitat Pompeu Fabra
dc.rights ADVERTIMENT. L'accés als continguts d'aquesta tesi doctoral i la seva utilització ha de respectar els drets de la persona autora. Pot ser utilitzada per a consulta o estudi personal, així com en activitats o materials d'investigació i docència en els termes establerts a l'art. 32 del Text Refós de la Llei de Propietat Intel·lectual (RDL 1/1996). Per altres utilitzacions es requereix l'autorització prèvia i expressa de la persona autora. En qualsevol cas, en la utilització dels seus continguts caldrà indicar de forma clara el nom i cognoms de la persona autora i el títol de la tesi doctoral. No s'autoritza la seva reproducció o altres formes d'explotació efectuades amb finalitats de lucre ni la seva comunicació pública des d'un lloc aliè al servei TDX. Tampoc s'autoritza la presentació del seu contingut en una finestra o marc aliè a TDX (framing). Aquesta reserva de drets afecta tant als continguts de la tesi com als seus resums i índexs.
dc.rights info:eu-repo/semantics/openAccess
dc.title Role of linker Histone H1 variants in cell proliferation, Chromatin Structure and Gene expression in breast cancer cells
dc.date.modified 2013-07-10T11:29:03Z
dc.subject.keyword Expresión génica
dc.subject.keyword Cromatina
dc.subject.keyword Histona H1.5
dc.subject.keyword Histona H1.4
dc.subject.keyword Histona H1.3
dc.subject.keyword Histona H1.2
dc.subject.keyword Histona H1.0
dc.subject.keyword Variantes H1
dc.subject.keyword Histona internucleosómica
dc.subject.keyword Histona H1
dc.subject.keyword Gene expression
dc.subject.keyword Chromatin
dc.subject.keyword Histone H1.5
dc.subject.keyword Histone H1.4
dc.subject.keyword Histone H1.3
dc.subject.keyword Histone H1.2
dc.subject.keyword Histone H1.0
dc.subject.keyword H1 variants
dc.subject.keyword Histone H1
dc.subject.keyword Linker histone
dc.subject.keyword 57

See full text
http://hdl.handle.net/10803/7118

Search


Advanced Search

Browse

My Account

Statistics