Proteómica de expresión diferencial en Acinetobacter baumanii resistente a colistina

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Rodríguez Falcón, Manuel. Proteómica de expresión diferencial en Acinetobacter baumanii resistente a colistina. 2010
http://hdl.handle.net/10230/11763
dc.contributor.author Rodríguez Falcón, Manuel
dc.contributor.other Andreu Martínez, David
dc.contributor.other Universitat Pompeu Fabra. Departament de Ciències Experimentals i de la Salut
dc.date.accessioned 2013-07-12T01:49:35Z
dc.date.available 2013-07-12T01:49:35Z
dc.date.issued 2010-10-07
dc.identifier.uri http://hdl.handle.net/10230/11763
dc.description.abstract Normally present in water, soil and waste water, Acinetobacter baumannii has become animportant nosocomial pathogen, as causal agent of pneumonias, septicemias and urinarytract infections, among other complications in compromised patients from hospital’sintensive care units. One of its last acquired abilities is the resistance to colistin (polymixinE), the last therapeutic option for its infections. In this thesis, descriptive and quantitativedifferential expression proteomics is used in the study of acquired colistin resistance. Asresult of this research, 1,097 proteins belonging to the Acinetobacter genus have beenidentified by combined application of bidimensional gel electrophoresis (2DE), differentialgel electrophoresis (DIGE), and peptide labeling with stable isobaric isotopes tags(iTRAQ). Analyses have been performed on the global expressed proteome of a reference,colistin-sensible strain (A. baumannii ATCC 19606) and, for comparative purposes, on aderived strain on which colistin resistance has been induced in vitro. The resistantphenotype shows reduced fitness, with significant differences in expression found in outermembrane proteins, membrane active transporters, diverse metabolic enzymes (fatty acids,citrate, phenylacetate, piruvate and nitrogen), proteins involved in stress response andbiofilm formation, as well as in protein synthesis and folding pathways. The work hasallowed to assess the strengths and weaknesses of the different techniques currently used inthis type of proteomic analysis.
dc.description.abstract Acinetobacter baumannii, normalmente aislado en suelos y aguas (corrientes o residuales), seha convertido en importante patógeno nosocomial, siendo agente causal de, entre otrascomplicaciones, neumonías, septicemias e infecciones del tracto urinario de pacientescomprometidos en unidades hospitalarias de cuidados intensivos. La más reciente de suscapacidades adquiridas es la resistencia a colistina (polimixina E), antibiótico peptídicoconsiderado la última opción terapéutica en contextos clínicos. Esta tesis doctoral emplea laproteómica descriptiva y de expresión diferencial cuantitativa para investigar la resistenciaadquirida por A. baumannii a dicho antibiótico. Los resultados han supuesto laidentificación de 1.097 proteínas de Acinetobacter mediante el empleo combinado deelectroforesis bidimensional convencional (2DE), 2DE diferencial (DIGE) y marcajepeptídico mediante isótopos isobáricos estables (iTRAQ). Los análisis se han realizado enel proteoma expresado por una cepa de referencia sensible a colistina (A. baumannii ATCC19606), así como en una cepa derivada de ésta en la que se ha inducido, a efectoscomparativos, resistencia a colistina in vitro. El fenotipo resistente manifestó reducidaadaptabilidad biológica, encontrándose las principales diferencias en la estructura de lamembrana externa, en la expresión de transportadores activos de membrana, en diversosenzimas metabólicos (ácidos grasos, citrato, fenilacetato, piruvato, nitrógeno) y derespuesta a condiciones de estrés, así como en la expresión de proteínas participantes en laformación de biopelículas y en el proceso de síntesis y plegamiento de proteínas. Además,el trabajo ha permitido evaluar los puntos fuertes y débiles de las técnicas empleadasactualmente en este tipo de análisis proteómicos.
dc.format.mimetype 395 p.
dc.format.mimetype application/pdf
dc.language.iso spa
dc.publisher Universitat Pompeu Fabra
dc.rights info:eu-repo/semantics/openAccess
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dc.title Proteómica de expresión diferencial en Acinetobacter baumanii resistente a colistina
dc.date.modified 2013-07-10T11:29:09Z
dc.subject.keyword Acinetobacter baumannii
dc.subject.keyword Antibiotic resistance
dc.subject.keyword Biological fitness
dc.subject.keyword Polymyxin
dc.subject.keyword 2DE
dc.subject.keyword DIGE
dc.subject.keyword iTRAQ
dc.subject.keyword Resistencia antibiótica
dc.subject.keyword Adaptabilidad biológica
dc.subject.keyword Colistina
dc.subject.keyword 57

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http://hdl.handle.net/10803/31820

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